Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGJ6

HDGFL1, Hepatoma-derived growth factor-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL1Q5TGJ6 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
HDGFL1Q5TGJ6 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC37.31■■■■□ 3.56
HDGFL1Q5TGJ6 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC37.3■■■■□ 3.56
HDGFL1Q5TGJ6 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
HDGFL1Q5TGJ6 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
HDGFL1Q5TGJ6 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
HDGFL1Q5TGJ6 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
HDGFL1Q5TGJ6 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
HDGFL1Q5TGJ6 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC37.17■■■■□ 3.54
HDGFL1Q5TGJ6 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC37.15■■■■□ 3.54
HDGFL1Q5TGJ6 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC37.13■■■■□ 3.53
HDGFL1Q5TGJ6 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC37.13■■■■□ 3.53
HDGFL1Q5TGJ6 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
HDGFL1Q5TGJ6 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
HDGFL1Q5TGJ6 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
HDGFL1Q5TGJ6 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
HDGFL1Q5TGJ6 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.08■■■■□ 3.53
HDGFL1Q5TGJ6 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
HDGFL1Q5TGJ6 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.52
HDGFL1Q5TGJ6 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
HDGFL1Q5TGJ6 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.04■■■■□ 3.52
HDGFL1Q5TGJ6 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC37.01■■■■□ 3.52
HDGFL1Q5TGJ6 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
HDGFL1Q5TGJ6 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
HDGFL1Q5TGJ6 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
HDGFL1Q5TGJ6 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
HDGFL1Q5TGJ6 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
HDGFL1Q5TGJ6 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
HDGFL1Q5TGJ6 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.89■■■■□ 3.5
HDGFL1Q5TGJ6 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
HDGFL1Q5TGJ6 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
HDGFL1Q5TGJ6 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC36.83■■■■□ 3.49
HDGFL1Q5TGJ6 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
HDGFL1Q5TGJ6 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.82■■■■□ 3.49
HDGFL1Q5TGJ6 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
HDGFL1Q5TGJ6 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC36.79■■■■□ 3.48
HDGFL1Q5TGJ6 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC36.79■■■■□ 3.48
HDGFL1Q5TGJ6 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC36.77■■■■□ 3.48
HDGFL1Q5TGJ6 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
HDGFL1Q5TGJ6 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC36.74■■■■□ 3.47
HDGFL1Q5TGJ6 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC36.74■■■■□ 3.47
HDGFL1Q5TGJ6 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC36.72■■■■□ 3.47
HDGFL1Q5TGJ6 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
HDGFL1Q5TGJ6 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
HDGFL1Q5TGJ6 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
HDGFL1Q5TGJ6 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
HDGFL1Q5TGJ6 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
HDGFL1Q5TGJ6 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
HDGFL1Q5TGJ6 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
HDGFL1Q5TGJ6 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC36.54■■■■□ 3.44
HDGFL1Q5TGJ6 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC36.51■■■■□ 3.44
HDGFL1Q5TGJ6 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
HDGFL1Q5TGJ6 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC36.47■■■■□ 3.43
HDGFL1Q5TGJ6 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
HDGFL1Q5TGJ6 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
HDGFL1Q5TGJ6 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
HDGFL1Q5TGJ6 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
HDGFL1Q5TGJ6 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
HDGFL1Q5TGJ6 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
HDGFL1Q5TGJ6 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
HDGFL1Q5TGJ6 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
HDGFL1Q5TGJ6 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
HDGFL1Q5TGJ6 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
HDGFL1Q5TGJ6 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC36.38■■■■□ 3.41
HDGFL1Q5TGJ6 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
HDGFL1Q5TGJ6 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
HDGFL1Q5TGJ6 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC36.35■■■■□ 3.41
HDGFL1Q5TGJ6 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
HDGFL1Q5TGJ6 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
HDGFL1Q5TGJ6 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC36.3■■■■□ 3.4
HDGFL1Q5TGJ6 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
HDGFL1Q5TGJ6 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
HDGFL1Q5TGJ6 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
HDGFL1Q5TGJ6 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
HDGFL1Q5TGJ6 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC36.27■■■■□ 3.4
HDGFL1Q5TGJ6 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
HDGFL1Q5TGJ6 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
HDGFL1Q5TGJ6 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
HDGFL1Q5TGJ6 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC36.22■■■■□ 3.39
HDGFL1Q5TGJ6 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC36.16■■■■□ 3.38
HDGFL1Q5TGJ6 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
HDGFL1Q5TGJ6 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC36.11■■■■□ 3.37
HDGFL1Q5TGJ6 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
HDGFL1Q5TGJ6 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
HDGFL1Q5TGJ6 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
HDGFL1Q5TGJ6 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.36
HDGFL1Q5TGJ6 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC36.07■■■■□ 3.36
HDGFL1Q5TGJ6 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
HDGFL1Q5TGJ6 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
HDGFL1Q5TGJ6 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
HDGFL1Q5TGJ6 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
HDGFL1Q5TGJ6 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.03■■■■□ 3.36
HDGFL1Q5TGJ6 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
HDGFL1Q5TGJ6 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
HDGFL1Q5TGJ6 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
HDGFL1Q5TGJ6 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC35.95■■■■□ 3.35
HDGFL1Q5TGJ6 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC35.93■■■■□ 3.34
HDGFL1Q5TGJ6 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
HDGFL1Q5TGJ6 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
HDGFL1Q5TGJ6 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms