Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUW0

KRBOX4, KRAB domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRBOX4Q5JUW0 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRBOX4Q5JUW0 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRBOX4Q5JUW0 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRBOX4Q5JUW0 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRBOX4Q5JUW0 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRBOX4Q5JUW0 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
KRBOX4Q5JUW0 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRBOX4Q5JUW0 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRBOX4Q5JUW0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRBOX4Q5JUW0 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRBOX4Q5JUW0 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRBOX4Q5JUW0 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRBOX4Q5JUW0 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRBOX4Q5JUW0 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRBOX4Q5JUW0 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRBOX4Q5JUW0 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRBOX4Q5JUW0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRBOX4Q5JUW0 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
KRBOX4Q5JUW0 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRBOX4Q5JUW0 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRBOX4Q5JUW0 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRBOX4Q5JUW0 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRBOX4Q5JUW0 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRBOX4Q5JUW0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRBOX4Q5JUW0 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
KRBOX4Q5JUW0 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRBOX4Q5JUW0 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRBOX4Q5JUW0 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRBOX4Q5JUW0 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRBOX4Q5JUW0 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRBOX4Q5JUW0 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KRBOX4Q5JUW0 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KRBOX4Q5JUW0 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KRBOX4Q5JUW0 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KRBOX4Q5JUW0 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KRBOX4Q5JUW0 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KRBOX4Q5JUW0 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KRBOX4Q5JUW0 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KRBOX4Q5JUW0 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KRBOX4Q5JUW0 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KRBOX4Q5JUW0 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KRBOX4Q5JUW0 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KRBOX4Q5JUW0 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
KRBOX4Q5JUW0 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KRBOX4Q5JUW0 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRBOX4Q5JUW0 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRBOX4Q5JUW0 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRBOX4Q5JUW0 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRBOX4Q5JUW0 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRBOX4Q5JUW0 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRBOX4Q5JUW0 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRBOX4Q5JUW0 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRBOX4Q5JUW0 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRBOX4Q5JUW0 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRBOX4Q5JUW0 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRBOX4Q5JUW0 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRBOX4Q5JUW0 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRBOX4Q5JUW0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRBOX4Q5JUW0 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRBOX4Q5JUW0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRBOX4Q5JUW0 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRBOX4Q5JUW0 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRBOX4Q5JUW0 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRBOX4Q5JUW0 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRBOX4Q5JUW0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRBOX4Q5JUW0 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRBOX4Q5JUW0 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRBOX4Q5JUW0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRBOX4Q5JUW0 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRBOX4Q5JUW0 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRBOX4Q5JUW0 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRBOX4Q5JUW0 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRBOX4Q5JUW0 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRBOX4Q5JUW0 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRBOX4Q5JUW0 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRBOX4Q5JUW0 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRBOX4Q5JUW0 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRBOX4Q5JUW0 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRBOX4Q5JUW0 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRBOX4Q5JUW0 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRBOX4Q5JUW0 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRBOX4Q5JUW0 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRBOX4Q5JUW0 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.35
KRBOX4Q5JUW0 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
KRBOX4Q5JUW0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
KRBOX4Q5JUW0 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRBOX4Q5JUW0 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRBOX4Q5JUW0 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRBOX4Q5JUW0 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRBOX4Q5JUW0 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRBOX4Q5JUW0 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRBOX4Q5JUW0 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRBOX4Q5JUW0 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KRBOX4Q5JUW0 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KRBOX4Q5JUW0 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRBOX4Q5JUW0 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRBOX4Q5JUW0 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRBOX4Q5JUW0 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRBOX4Q5JUW0 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRBOX4Q5JUW0 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms