Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK2

SOHLH1, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOHLH1Q5JUK2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SOHLH1Q5JUK2 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SOHLH1Q5JUK2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SOHLH1Q5JUK2 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SOHLH1Q5JUK2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
SOHLH1Q5JUK2 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SOHLH1Q5JUK2 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SOHLH1Q5JUK2 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SOHLH1Q5JUK2 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SOHLH1Q5JUK2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SOHLH1Q5JUK2 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SOHLH1Q5JUK2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SOHLH1Q5JUK2 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SOHLH1Q5JUK2 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SOHLH1Q5JUK2 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SOHLH1Q5JUK2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SOHLH1Q5JUK2 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SOHLH1Q5JUK2 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SOHLH1Q5JUK2 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SOHLH1Q5JUK2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SOHLH1Q5JUK2 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SOHLH1Q5JUK2 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SOHLH1Q5JUK2 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SOHLH1Q5JUK2 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SOHLH1Q5JUK2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SOHLH1Q5JUK2 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SOHLH1Q5JUK2 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOHLH1Q5JUK2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SOHLH1Q5JUK2 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SOHLH1Q5JUK2 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SOHLH1Q5JUK2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SOHLH1Q5JUK2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SOHLH1Q5JUK2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SOHLH1Q5JUK2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SOHLH1Q5JUK2 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SOHLH1Q5JUK2 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SOHLH1Q5JUK2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SOHLH1Q5JUK2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SOHLH1Q5JUK2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SOHLH1Q5JUK2 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SOHLH1Q5JUK2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SOHLH1Q5JUK2 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SOHLH1Q5JUK2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SOHLH1Q5JUK2 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SOHLH1Q5JUK2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SOHLH1Q5JUK2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SOHLH1Q5JUK2 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SOHLH1Q5JUK2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SOHLH1Q5JUK2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SOHLH1Q5JUK2 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SOHLH1Q5JUK2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SOHLH1Q5JUK2 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SOHLH1Q5JUK2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SOHLH1Q5JUK2 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SOHLH1Q5JUK2 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SOHLH1Q5JUK2 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SOHLH1Q5JUK2 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SOHLH1Q5JUK2 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SOHLH1Q5JUK2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SOHLH1Q5JUK2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SOHLH1Q5JUK2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SOHLH1Q5JUK2 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SOHLH1Q5JUK2 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SOHLH1Q5JUK2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SOHLH1Q5JUK2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SOHLH1Q5JUK2 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SOHLH1Q5JUK2 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SOHLH1Q5JUK2 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOHLH1Q5JUK2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOHLH1Q5JUK2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SOHLH1Q5JUK2 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SOHLH1Q5JUK2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SOHLH1Q5JUK2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SOHLH1Q5JUK2 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SOHLH1Q5JUK2 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SOHLH1Q5JUK2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SOHLH1Q5JUK2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SOHLH1Q5JUK2 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SOHLH1Q5JUK2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SOHLH1Q5JUK2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SOHLH1Q5JUK2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SOHLH1Q5JUK2 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOHLH1Q5JUK2 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SOHLH1Q5JUK2 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SOHLH1Q5JUK2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SOHLH1Q5JUK2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SOHLH1Q5JUK2 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SOHLH1Q5JUK2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SOHLH1Q5JUK2 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SOHLH1Q5JUK2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SOHLH1Q5JUK2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SOHLH1Q5JUK2 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SOHLH1Q5JUK2 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SOHLH1Q5JUK2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SOHLH1Q5JUK2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SOHLH1Q5JUK2 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SOHLH1Q5JUK2 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SOHLH1Q5JUK2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SOHLH1Q5JUK2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SOHLH1Q5JUK2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms