Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
ODF2Q5BJF6 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
ODF2Q5BJF6 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
ODF2Q5BJF6 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
ODF2Q5BJF6 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
ODF2Q5BJF6 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
ODF2Q5BJF6 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC30.13■■■□□ 2.41
ODF2Q5BJF6 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
ODF2Q5BJF6 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
ODF2Q5BJF6 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
ODF2Q5BJF6 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
ODF2Q5BJF6 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
ODF2Q5BJF6 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
ODF2Q5BJF6 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
ODF2Q5BJF6 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
ODF2Q5BJF6 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
ODF2Q5BJF6 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
ODF2Q5BJF6 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
ODF2Q5BJF6 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ODF2Q5BJF6 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ODF2Q5BJF6 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ODF2Q5BJF6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ODF2Q5BJF6 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ODF2Q5BJF6 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ODF2Q5BJF6 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
ODF2Q5BJF6 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
ODF2Q5BJF6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
ODF2Q5BJF6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
ODF2Q5BJF6 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
ODF2Q5BJF6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ODF2Q5BJF6 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ODF2Q5BJF6 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
ODF2Q5BJF6 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ODF2Q5BJF6 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
ODF2Q5BJF6 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
ODF2Q5BJF6 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
ODF2Q5BJF6 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
ODF2Q5BJF6 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ODF2Q5BJF6 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ODF2Q5BJF6 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
ODF2Q5BJF6 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
ODF2Q5BJF6 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
ODF2Q5BJF6 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
ODF2Q5BJF6 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
ODF2Q5BJF6 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
ODF2Q5BJF6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
ODF2Q5BJF6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
ODF2Q5BJF6 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
ODF2Q5BJF6 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
ODF2Q5BJF6 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ODF2Q5BJF6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
ODF2Q5BJF6 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
ODF2Q5BJF6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
ODF2Q5BJF6 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
ODF2Q5BJF6 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ODF2Q5BJF6 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
ODF2Q5BJF6 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ODF2Q5BJF6 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
ODF2Q5BJF6 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ODF2Q5BJF6 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ODF2Q5BJF6 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ODF2Q5BJF6 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ODF2Q5BJF6 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ODF2Q5BJF6 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ODF2Q5BJF6 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ODF2Q5BJF6 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ODF2Q5BJF6 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ODF2Q5BJF6 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ODF2Q5BJF6 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ODF2Q5BJF6 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ODF2Q5BJF6 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ODF2Q5BJF6 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ODF2Q5BJF6 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
ODF2Q5BJF6 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ODF2Q5BJF6 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ODF2Q5BJF6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ODF2Q5BJF6 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ODF2Q5BJF6 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
ODF2Q5BJF6 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ODF2Q5BJF6 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ODF2Q5BJF6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ODF2Q5BJF6 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ODF2Q5BJF6 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ODF2Q5BJF6 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ODF2Q5BJF6 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ODF2Q5BJF6 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
ODF2Q5BJF6 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ODF2Q5BJF6 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ODF2Q5BJF6 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ODF2Q5BJF6 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ODF2Q5BJF6 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
ODF2Q5BJF6 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ODF2Q5BJF6 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ODF2Q5BJF6 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ODF2Q5BJF6 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ODF2Q5BJF6 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ODF2Q5BJF6 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ODF2Q5BJF6 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ODF2Q5BJF6 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ODF2Q5BJF6 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.7 ms