Protein–RNA interactions for Protein: Q56A73

SPIN4, Spindlin-4, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIN4Q56A73 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SPIN4Q56A73 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SPIN4Q56A73 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SPIN4Q56A73 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SPIN4Q56A73 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SPIN4Q56A73 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SPIN4Q56A73 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SPIN4Q56A73 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SPIN4Q56A73 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SPIN4Q56A73 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SPIN4Q56A73 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SPIN4Q56A73 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SPIN4Q56A73 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SPIN4Q56A73 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SPIN4Q56A73 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SPIN4Q56A73 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SPIN4Q56A73 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SPIN4Q56A73 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
SPIN4Q56A73 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SPIN4Q56A73 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SPIN4Q56A73 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SPIN4Q56A73 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SPIN4Q56A73 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SPIN4Q56A73 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SPIN4Q56A73 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SPIN4Q56A73 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SPIN4Q56A73 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SPIN4Q56A73 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SPIN4Q56A73 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SPIN4Q56A73 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SPIN4Q56A73 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SPIN4Q56A73 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
SPIN4Q56A73 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SPIN4Q56A73 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SPIN4Q56A73 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SPIN4Q56A73 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SPIN4Q56A73 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SPIN4Q56A73 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SPIN4Q56A73 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SPIN4Q56A73 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SPIN4Q56A73 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SPIN4Q56A73 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SPIN4Q56A73 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SPIN4Q56A73 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SPIN4Q56A73 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SPIN4Q56A73 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
SPIN4Q56A73 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SPIN4Q56A73 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SPIN4Q56A73 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SPIN4Q56A73 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SPIN4Q56A73 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SPIN4Q56A73 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SPIN4Q56A73 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SPIN4Q56A73 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SPIN4Q56A73 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SPIN4Q56A73 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SPIN4Q56A73 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SPIN4Q56A73 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SPIN4Q56A73 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SPIN4Q56A73 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SPIN4Q56A73 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SPIN4Q56A73 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SPIN4Q56A73 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SPIN4Q56A73 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SPIN4Q56A73 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SPIN4Q56A73 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SPIN4Q56A73 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SPIN4Q56A73 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SPIN4Q56A73 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SPIN4Q56A73 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SPIN4Q56A73 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SPIN4Q56A73 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SPIN4Q56A73 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SPIN4Q56A73 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SPIN4Q56A73 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SPIN4Q56A73 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SPIN4Q56A73 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SPIN4Q56A73 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SPIN4Q56A73 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SPIN4Q56A73 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SPIN4Q56A73 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SPIN4Q56A73 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SPIN4Q56A73 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SPIN4Q56A73 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SPIN4Q56A73 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SPIN4Q56A73 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SPIN4Q56A73 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SPIN4Q56A73 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SPIN4Q56A73 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SPIN4Q56A73 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SPIN4Q56A73 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SPIN4Q56A73 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SPIN4Q56A73 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SPIN4Q56A73 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SPIN4Q56A73 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SPIN4Q56A73 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SPIN4Q56A73 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SPIN4Q56A73 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SPIN4Q56A73 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SPIN4Q56A73 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms