Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI81

KRTAP27-1, Keratin-associated protein 27-1, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP27-1Q3LI81 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRTAP27-1Q3LI81 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
KRTAP27-1Q3LI81 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRTAP27-1Q3LI81 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRTAP27-1Q3LI81 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRTAP27-1Q3LI81 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRTAP27-1Q3LI81 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRTAP27-1Q3LI81 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRTAP27-1Q3LI81 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRTAP27-1Q3LI81 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRTAP27-1Q3LI81 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRTAP27-1Q3LI81 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRTAP27-1Q3LI81 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRTAP27-1Q3LI81 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRTAP27-1Q3LI81 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRTAP27-1Q3LI81 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRTAP27-1Q3LI81 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRTAP27-1Q3LI81 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRTAP27-1Q3LI81 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRTAP27-1Q3LI81 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRTAP27-1Q3LI81 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRTAP27-1Q3LI81 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRTAP27-1Q3LI81 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRTAP27-1Q3LI81 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRTAP27-1Q3LI81 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRTAP27-1Q3LI81 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRTAP27-1Q3LI81 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRTAP27-1Q3LI81 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRTAP27-1Q3LI81 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRTAP27-1Q3LI81 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRTAP27-1Q3LI81 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KRTAP27-1Q3LI81 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KRTAP27-1Q3LI81 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRTAP27-1Q3LI81 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRTAP27-1Q3LI81 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRTAP27-1Q3LI81 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRTAP27-1Q3LI81 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRTAP27-1Q3LI81 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRTAP27-1Q3LI81 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KRTAP27-1Q3LI81 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRTAP27-1Q3LI81 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRTAP27-1Q3LI81 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRTAP27-1Q3LI81 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRTAP27-1Q3LI81 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KRTAP27-1Q3LI81 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
KRTAP27-1Q3LI81 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRTAP27-1Q3LI81 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRTAP27-1Q3LI81 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRTAP27-1Q3LI81 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRTAP27-1Q3LI81 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRTAP27-1Q3LI81 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRTAP27-1Q3LI81 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRTAP27-1Q3LI81 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRTAP27-1Q3LI81 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRTAP27-1Q3LI81 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRTAP27-1Q3LI81 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRTAP27-1Q3LI81 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRTAP27-1Q3LI81 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRTAP27-1Q3LI81 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
KRTAP27-1Q3LI81 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KRTAP27-1Q3LI81 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRTAP27-1Q3LI81 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRTAP27-1Q3LI81 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRTAP27-1Q3LI81 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRTAP27-1Q3LI81 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRTAP27-1Q3LI81 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRTAP27-1Q3LI81 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KRTAP27-1Q3LI81 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRTAP27-1Q3LI81 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRTAP27-1Q3LI81 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRTAP27-1Q3LI81 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRTAP27-1Q3LI81 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRTAP27-1Q3LI81 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRTAP27-1Q3LI81 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRTAP27-1Q3LI81 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRTAP27-1Q3LI81 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
KRTAP27-1Q3LI81 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRTAP27-1Q3LI81 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRTAP27-1Q3LI81 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRTAP27-1Q3LI81 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRTAP27-1Q3LI81 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRTAP27-1Q3LI81 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRTAP27-1Q3LI81 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRTAP27-1Q3LI81 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRTAP27-1Q3LI81 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRTAP27-1Q3LI81 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRTAP27-1Q3LI81 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
KRTAP27-1Q3LI81 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRTAP27-1Q3LI81 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRTAP27-1Q3LI81 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRTAP27-1Q3LI81 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRTAP27-1Q3LI81 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRTAP27-1Q3LI81 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRTAP27-1Q3LI81 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRTAP27-1Q3LI81 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRTAP27-1Q3LI81 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRTAP27-1Q3LI81 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRTAP27-1Q3LI81 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRTAP27-1Q3LI81 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRTAP27-1Q3LI81 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.6 ms