Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
KRTAP21-1Q3LI58 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
KRTAP21-1Q3LI58 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
KRTAP21-1Q3LI58 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
KRTAP21-1Q3LI58 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
KRTAP21-1Q3LI58 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
KRTAP21-1Q3LI58 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
KRTAP21-1Q3LI58 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
KRTAP21-1Q3LI58 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
KRTAP21-1Q3LI58 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
KRTAP21-1Q3LI58 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
KRTAP21-1Q3LI58 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
KRTAP21-1Q3LI58 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
KRTAP21-1Q3LI58 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
KRTAP21-1Q3LI58 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
KRTAP21-1Q3LI58 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
KRTAP21-1Q3LI58 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
KRTAP21-1Q3LI58 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
KRTAP21-1Q3LI58 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
KRTAP21-1Q3LI58 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
KRTAP21-1Q3LI58 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
KRTAP21-1Q3LI58 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
KRTAP21-1Q3LI58 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
KRTAP21-1Q3LI58 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
KRTAP21-1Q3LI58 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
KRTAP21-1Q3LI58 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
KRTAP21-1Q3LI58 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
KRTAP21-1Q3LI58 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
KRTAP21-1Q3LI58 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
KRTAP21-1Q3LI58 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
KRTAP21-1Q3LI58 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
KRTAP21-1Q3LI58 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
KRTAP21-1Q3LI58 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
KRTAP21-1Q3LI58 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
KRTAP21-1Q3LI58 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
KRTAP21-1Q3LI58 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
KRTAP21-1Q3LI58 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC4.4□□□□□ -1.7
KRTAP21-1Q3LI58 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
KRTAP21-1Q3LI58 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
KRTAP21-1Q3LI58 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
KRTAP21-1Q3LI58 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
KRTAP21-1Q3LI58 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
KRTAP21-1Q3LI58 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
KRTAP21-1Q3LI58 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
KRTAP21-1Q3LI58 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
KRTAP21-1Q3LI58 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
KRTAP21-1Q3LI58 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
KRTAP21-1Q3LI58 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
KRTAP21-1Q3LI58 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
KRTAP21-1Q3LI58 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
KRTAP21-1Q3LI58 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
KRTAP21-1Q3LI58 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
KRTAP21-1Q3LI58 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
KRTAP21-1Q3LI58 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
KRTAP21-1Q3LI58 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
KRTAP21-1Q3LI58 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
KRTAP21-1Q3LI58 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
KRTAP21-1Q3LI58 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
KRTAP21-1Q3LI58 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC4.36□□□□□ -1.71
KRTAP21-1Q3LI58 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
KRTAP21-1Q3LI58 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
KRTAP21-1Q3LI58 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
KRTAP21-1Q3LI58 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC4.36□□□□□ -1.71
KRTAP21-1Q3LI58 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
KRTAP21-1Q3LI58 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
KRTAP21-1Q3LI58 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
KRTAP21-1Q3LI58 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
KRTAP21-1Q3LI58 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
KRTAP21-1Q3LI58 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
KRTAP21-1Q3LI58 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
KRTAP21-1Q3LI58 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
KRTAP21-1Q3LI58 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
KRTAP21-1Q3LI58 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
KRTAP21-1Q3LI58 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC4.34□□□□□ -1.71
KRTAP21-1Q3LI58 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.72
KRTAP21-1Q3LI58 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.72
KRTAP21-1Q3LI58 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.72
KRTAP21-1Q3LI58 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
KRTAP21-1Q3LI58 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
KRTAP21-1Q3LI58 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
KRTAP21-1Q3LI58 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
KRTAP21-1Q3LI58 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
KRTAP21-1Q3LI58 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
KRTAP21-1Q3LI58 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
KRTAP21-1Q3LI58 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
KRTAP21-1Q3LI58 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
KRTAP21-1Q3LI58 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
KRTAP21-1Q3LI58 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
KRTAP21-1Q3LI58 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
KRTAP21-1Q3LI58 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
KRTAP21-1Q3LI58 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
KRTAP21-1Q3LI58 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
KRTAP21-1Q3LI58 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
KRTAP21-1Q3LI58 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
KRTAP21-1Q3LI58 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
KRTAP21-1Q3LI58 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms