Protein–RNA interactions for Protein: Q3KR37

GRAMD1B, GRAM domain-containing protein 1B, humanhuman

Predictions only

Length 738 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD1BQ3KR37 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
GRAMD1BQ3KR37 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
GRAMD1BQ3KR37 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GRAMD1BQ3KR37 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GRAMD1BQ3KR37 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GRAMD1BQ3KR37 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GRAMD1BQ3KR37 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GRAMD1BQ3KR37 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GRAMD1BQ3KR37 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GRAMD1BQ3KR37 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GRAMD1BQ3KR37 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GRAMD1BQ3KR37 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GRAMD1BQ3KR37 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GRAMD1BQ3KR37 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GRAMD1BQ3KR37 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GRAMD1BQ3KR37 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GRAMD1BQ3KR37 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GRAMD1BQ3KR37 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GRAMD1BQ3KR37 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GRAMD1BQ3KR37 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GRAMD1BQ3KR37 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
GRAMD1BQ3KR37 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
GRAMD1BQ3KR37 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GRAMD1BQ3KR37 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GRAMD1BQ3KR37 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
GRAMD1BQ3KR37 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GRAMD1BQ3KR37 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GRAMD1BQ3KR37 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GRAMD1BQ3KR37 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GRAMD1BQ3KR37 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GRAMD1BQ3KR37 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GRAMD1BQ3KR37 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GRAMD1BQ3KR37 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GRAMD1BQ3KR37 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GRAMD1BQ3KR37 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GRAMD1BQ3KR37 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GRAMD1BQ3KR37 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GRAMD1BQ3KR37 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GRAMD1BQ3KR37 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GRAMD1BQ3KR37 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GRAMD1BQ3KR37 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GRAMD1BQ3KR37 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GRAMD1BQ3KR37 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GRAMD1BQ3KR37 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GRAMD1BQ3KR37 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GRAMD1BQ3KR37 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
GRAMD1BQ3KR37 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GRAMD1BQ3KR37 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GRAMD1BQ3KR37 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GRAMD1BQ3KR37 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GRAMD1BQ3KR37 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GRAMD1BQ3KR37 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GRAMD1BQ3KR37 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GRAMD1BQ3KR37 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GRAMD1BQ3KR37 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GRAMD1BQ3KR37 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GRAMD1BQ3KR37 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GRAMD1BQ3KR37 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GRAMD1BQ3KR37 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GRAMD1BQ3KR37 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GRAMD1BQ3KR37 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GRAMD1BQ3KR37 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GRAMD1BQ3KR37 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GRAMD1BQ3KR37 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GRAMD1BQ3KR37 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GRAMD1BQ3KR37 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GRAMD1BQ3KR37 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GRAMD1BQ3KR37 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
GRAMD1BQ3KR37 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GRAMD1BQ3KR37 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GRAMD1BQ3KR37 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GRAMD1BQ3KR37 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GRAMD1BQ3KR37 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GRAMD1BQ3KR37 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GRAMD1BQ3KR37 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GRAMD1BQ3KR37 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GRAMD1BQ3KR37 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GRAMD1BQ3KR37 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
GRAMD1BQ3KR37 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GRAMD1BQ3KR37 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GRAMD1BQ3KR37 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
GRAMD1BQ3KR37 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GRAMD1BQ3KR37 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GRAMD1BQ3KR37 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GRAMD1BQ3KR37 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GRAMD1BQ3KR37 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GRAMD1BQ3KR37 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GRAMD1BQ3KR37 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GRAMD1BQ3KR37 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GRAMD1BQ3KR37 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GRAMD1BQ3KR37 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GRAMD1BQ3KR37 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GRAMD1BQ3KR37 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
GRAMD1BQ3KR37 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GRAMD1BQ3KR37 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GRAMD1BQ3KR37 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GRAMD1BQ3KR37 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GRAMD1BQ3KR37 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GRAMD1BQ3KR37 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GRAMD1BQ3KR37 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms