Protein–RNA interactions for Protein: Q30KQ4

DEFB116, Beta-defensin 116, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFB116Q30KQ4 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DEFB116Q30KQ4 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DEFB116Q30KQ4 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DEFB116Q30KQ4 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DEFB116Q30KQ4 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DEFB116Q30KQ4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DEFB116Q30KQ4 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DEFB116Q30KQ4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DEFB116Q30KQ4 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DEFB116Q30KQ4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DEFB116Q30KQ4 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DEFB116Q30KQ4 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DEFB116Q30KQ4 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DEFB116Q30KQ4 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DEFB116Q30KQ4 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DEFB116Q30KQ4 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DEFB116Q30KQ4 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
DEFB116Q30KQ4 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DEFB116Q30KQ4 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DEFB116Q30KQ4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DEFB116Q30KQ4 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DEFB116Q30KQ4 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DEFB116Q30KQ4 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DEFB116Q30KQ4 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DEFB116Q30KQ4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DEFB116Q30KQ4 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DEFB116Q30KQ4 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DEFB116Q30KQ4 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DEFB116Q30KQ4 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DEFB116Q30KQ4 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DEFB116Q30KQ4 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DEFB116Q30KQ4 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DEFB116Q30KQ4 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DEFB116Q30KQ4 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DEFB116Q30KQ4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DEFB116Q30KQ4 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DEFB116Q30KQ4 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DEFB116Q30KQ4 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DEFB116Q30KQ4 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DEFB116Q30KQ4 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DEFB116Q30KQ4 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DEFB116Q30KQ4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DEFB116Q30KQ4 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DEFB116Q30KQ4 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DEFB116Q30KQ4 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DEFB116Q30KQ4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DEFB116Q30KQ4 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DEFB116Q30KQ4 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DEFB116Q30KQ4 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DEFB116Q30KQ4 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DEFB116Q30KQ4 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DEFB116Q30KQ4 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
DEFB116Q30KQ4 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DEFB116Q30KQ4 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DEFB116Q30KQ4 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DEFB116Q30KQ4 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DEFB116Q30KQ4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DEFB116Q30KQ4 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DEFB116Q30KQ4 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DEFB116Q30KQ4 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DEFB116Q30KQ4 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DEFB116Q30KQ4 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DEFB116Q30KQ4 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DEFB116Q30KQ4 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DEFB116Q30KQ4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DEFB116Q30KQ4 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DEFB116Q30KQ4 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DEFB116Q30KQ4 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DEFB116Q30KQ4 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DEFB116Q30KQ4 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DEFB116Q30KQ4 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DEFB116Q30KQ4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DEFB116Q30KQ4 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DEFB116Q30KQ4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DEFB116Q30KQ4 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DEFB116Q30KQ4 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DEFB116Q30KQ4 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DEFB116Q30KQ4 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DEFB116Q30KQ4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DEFB116Q30KQ4 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DEFB116Q30KQ4 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DEFB116Q30KQ4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DEFB116Q30KQ4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DEFB116Q30KQ4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DEFB116Q30KQ4 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DEFB116Q30KQ4 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DEFB116Q30KQ4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DEFB116Q30KQ4 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DEFB116Q30KQ4 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DEFB116Q30KQ4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DEFB116Q30KQ4 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DEFB116Q30KQ4 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DEFB116Q30KQ4 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DEFB116Q30KQ4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DEFB116Q30KQ4 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DEFB116Q30KQ4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DEFB116Q30KQ4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DEFB116Q30KQ4 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DEFB116Q30KQ4 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DEFB116Q30KQ4 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms