Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
CSPP1Q1MSJ5 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
CSPP1Q1MSJ5 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CSPP1Q1MSJ5 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
CSPP1Q1MSJ5 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
CSPP1Q1MSJ5 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
CSPP1Q1MSJ5 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
CSPP1Q1MSJ5 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC33.38■■■□□ 2.93
CSPP1Q1MSJ5 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
CSPP1Q1MSJ5 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC33.37■■■□□ 2.93
CSPP1Q1MSJ5 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
CSPP1Q1MSJ5 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CSPP1Q1MSJ5 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CSPP1Q1MSJ5 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
CSPP1Q1MSJ5 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
CSPP1Q1MSJ5 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
CSPP1Q1MSJ5 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CSPP1Q1MSJ5 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
CSPP1Q1MSJ5 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
CSPP1Q1MSJ5 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CSPP1Q1MSJ5 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CSPP1Q1MSJ5 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CSPP1Q1MSJ5 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
CSPP1Q1MSJ5 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
CSPP1Q1MSJ5 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
CSPP1Q1MSJ5 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
CSPP1Q1MSJ5 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CSPP1Q1MSJ5 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CSPP1Q1MSJ5 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
CSPP1Q1MSJ5 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
CSPP1Q1MSJ5 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
CSPP1Q1MSJ5 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
CSPP1Q1MSJ5 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
CSPP1Q1MSJ5 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
CSPP1Q1MSJ5 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
CSPP1Q1MSJ5 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
CSPP1Q1MSJ5 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
CSPP1Q1MSJ5 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
CSPP1Q1MSJ5 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
CSPP1Q1MSJ5 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
CSPP1Q1MSJ5 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
CSPP1Q1MSJ5 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC32.92■■■□□ 2.86
CSPP1Q1MSJ5 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC32.92■■■□□ 2.86
CSPP1Q1MSJ5 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
CSPP1Q1MSJ5 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
CSPP1Q1MSJ5 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC32.9■■■□□ 2.86
CSPP1Q1MSJ5 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
CSPP1Q1MSJ5 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
CSPP1Q1MSJ5 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.86■■■□□ 2.85
CSPP1Q1MSJ5 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
CSPP1Q1MSJ5 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
CSPP1Q1MSJ5 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
CSPP1Q1MSJ5 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
CSPP1Q1MSJ5 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
CSPP1Q1MSJ5 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
CSPP1Q1MSJ5 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
CSPP1Q1MSJ5 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
CSPP1Q1MSJ5 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
CSPP1Q1MSJ5 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
CSPP1Q1MSJ5 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
CSPP1Q1MSJ5 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
CSPP1Q1MSJ5 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC32.73■■■□□ 2.83
CSPP1Q1MSJ5 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
CSPP1Q1MSJ5 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
CSPP1Q1MSJ5 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
CSPP1Q1MSJ5 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
CSPP1Q1MSJ5 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
CSPP1Q1MSJ5 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
CSPP1Q1MSJ5 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
CSPP1Q1MSJ5 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC32.66■■■□□ 2.82
CSPP1Q1MSJ5 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
CSPP1Q1MSJ5 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
CSPP1Q1MSJ5 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
CSPP1Q1MSJ5 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
CSPP1Q1MSJ5 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
CSPP1Q1MSJ5 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
CSPP1Q1MSJ5 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
CSPP1Q1MSJ5 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
CSPP1Q1MSJ5 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
CSPP1Q1MSJ5 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
CSPP1Q1MSJ5 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
CSPP1Q1MSJ5 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
CSPP1Q1MSJ5 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.8
CSPP1Q1MSJ5 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
CSPP1Q1MSJ5 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
CSPP1Q1MSJ5 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
CSPP1Q1MSJ5 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
CSPP1Q1MSJ5 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
CSPP1Q1MSJ5 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
CSPP1Q1MSJ5 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
CSPP1Q1MSJ5 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
CSPP1Q1MSJ5 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
CSPP1Q1MSJ5 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
CSPP1Q1MSJ5 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
CSPP1Q1MSJ5 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CSPP1Q1MSJ5 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CSPP1Q1MSJ5 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
CSPP1Q1MSJ5 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC32.37■■■□□ 2.77
CSPP1Q1MSJ5 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
CSPP1Q1MSJ5 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms