Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
CSPP1Q1MSJ5 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
CSPP1Q1MSJ5 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CSPP1Q1MSJ5 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
CSPP1Q1MSJ5 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
CSPP1Q1MSJ5 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
CSPP1Q1MSJ5 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
CSPP1Q1MSJ5 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC33.38■■■□□ 2.93
CSPP1Q1MSJ5 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
CSPP1Q1MSJ5 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC33.37■■■□□ 2.93
CSPP1Q1MSJ5 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
CSPP1Q1MSJ5 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CSPP1Q1MSJ5 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CSPP1Q1MSJ5 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
CSPP1Q1MSJ5 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
CSPP1Q1MSJ5 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
CSPP1Q1MSJ5 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CSPP1Q1MSJ5 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
CSPP1Q1MSJ5 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
CSPP1Q1MSJ5 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CSPP1Q1MSJ5 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CSPP1Q1MSJ5 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CSPP1Q1MSJ5 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
CSPP1Q1MSJ5 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
CSPP1Q1MSJ5 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
CSPP1Q1MSJ5 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
CSPP1Q1MSJ5 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CSPP1Q1MSJ5 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CSPP1Q1MSJ5 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
CSPP1Q1MSJ5 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
CSPP1Q1MSJ5 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
CSPP1Q1MSJ5 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
CSPP1Q1MSJ5 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
CSPP1Q1MSJ5 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
CSPP1Q1MSJ5 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
CSPP1Q1MSJ5 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
CSPP1Q1MSJ5 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
CSPP1Q1MSJ5 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
CSPP1Q1MSJ5 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
CSPP1Q1MSJ5 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
CSPP1Q1MSJ5 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
CSPP1Q1MSJ5 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC32.92■■■□□ 2.86
CSPP1Q1MSJ5 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC32.92■■■□□ 2.86
CSPP1Q1MSJ5 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
CSPP1Q1MSJ5 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
CSPP1Q1MSJ5 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC32.9■■■□□ 2.86
CSPP1Q1MSJ5 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
CSPP1Q1MSJ5 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
CSPP1Q1MSJ5 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.86■■■□□ 2.85
CSPP1Q1MSJ5 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
CSPP1Q1MSJ5 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
CSPP1Q1MSJ5 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
CSPP1Q1MSJ5 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
CSPP1Q1MSJ5 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
CSPP1Q1MSJ5 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
CSPP1Q1MSJ5 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
CSPP1Q1MSJ5 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
CSPP1Q1MSJ5 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
CSPP1Q1MSJ5 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
CSPP1Q1MSJ5 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
CSPP1Q1MSJ5 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
CSPP1Q1MSJ5 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC32.73■■■□□ 2.83
CSPP1Q1MSJ5 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
CSPP1Q1MSJ5 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
CSPP1Q1MSJ5 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
CSPP1Q1MSJ5 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
CSPP1Q1MSJ5 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
CSPP1Q1MSJ5 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
CSPP1Q1MSJ5 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
CSPP1Q1MSJ5 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC32.66■■■□□ 2.82
CSPP1Q1MSJ5 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
CSPP1Q1MSJ5 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
CSPP1Q1MSJ5 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
CSPP1Q1MSJ5 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
CSPP1Q1MSJ5 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
CSPP1Q1MSJ5 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
CSPP1Q1MSJ5 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
CSPP1Q1MSJ5 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
CSPP1Q1MSJ5 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
CSPP1Q1MSJ5 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
CSPP1Q1MSJ5 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
CSPP1Q1MSJ5 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
CSPP1Q1MSJ5 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.8
CSPP1Q1MSJ5 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
CSPP1Q1MSJ5 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
CSPP1Q1MSJ5 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
CSPP1Q1MSJ5 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
CSPP1Q1MSJ5 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
CSPP1Q1MSJ5 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
CSPP1Q1MSJ5 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
CSPP1Q1MSJ5 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
CSPP1Q1MSJ5 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
CSPP1Q1MSJ5 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
CSPP1Q1MSJ5 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
CSPP1Q1MSJ5 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CSPP1Q1MSJ5 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CSPP1Q1MSJ5 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
CSPP1Q1MSJ5 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC32.37■■■□□ 2.77
CSPP1Q1MSJ5 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
CSPP1Q1MSJ5 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms