Protein–RNA interactions for Protein: Q17RY0

CPEB4, Cytoplasmic polyadenylation element-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPEB4Q17RY0 CELF1-203ENST00000361904 1580 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.869e-10■■■■■ 57.5
CPEB4Q17RY0 CELF1-205ENST00000395292 2191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.089e-10■■■■■ 57.5
CPEB4Q17RY0 CELF1-202ENST00000358597 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.169e-10■■■■■ 57.5
CPEB4Q17RY0 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.222e-9■■■■■ 57.3
CPEB4Q17RY0 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.242e-9■■■■■ 57.3
CPEB4Q17RY0 U2SURP-205ENST00000467348 1267 ntTSL 56.71□□□□□ -1.342e-9■■■■■ 57.3
CPEB4Q17RY0 U2SURP-211ENST00000488497 3557 ntTSL 1 (best)5.72□□□□□ -1.492e-9■■■■■ 57.3
CPEB4Q17RY0 ZFPM2-204ENST00000518180 596 ntTSL 45.04□□□□□ -1.62e-9■■■■■ 57.3
CPEB4Q17RY0 U2SURP-208ENST00000473835 7276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.742e-9■■■■■ 57.3
CPEB4Q17RY0 U2SURP-214ENST00000493598 3491 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.792e-9■■■■■ 57.3
CPEB4Q17RY0 U2SURP-209ENST00000480029 2855 ntTSL 23.67□□□□□ -1.822e-9■■■■■ 57.3
CPEB4Q17RY0 U2SURP-203ENST00000463563 4364 ntTSL 22.88□□□□□ -1.952e-9■■■■■ 57.3
CPEB4Q17RY0 SSBP2-203ENST00000504174 632 ntTSL 520.59■□□□□ 0.891e-8■■■■■ 55.4
CPEB4Q17RY0 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.591e-8■■■■■ 55.4
CPEB4Q17RY0 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.511e-8■■■■■ 55.4
CPEB4Q17RY0 SSBP2-208ENST00000507655 845 ntTSL 516.41■□□□□ 0.221e-8■■■■■ 55.4
CPEB4Q17RY0 SSBP2-207ENST00000507472 582 ntTSL 314.23□□□□□ -0.131e-8■■■■■ 55.4
CPEB4Q17RY0 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.361e-8■■■■■ 55.4
CPEB4Q17RY0 CDC123-209ENST00000498747 890 ntTSL 311.42□□□□□ -0.581e-8■■■■■ 55.4
CPEB4Q17RY0 SSBP2-215ENST00000512098 566 ntTSL 511.21□□□□□ -0.611e-8■■■■■ 55.4
CPEB4Q17RY0 CDC123-204ENST00000440613 685 ntTSL 510.42□□□□□ -0.741e-8■■■■■ 55.4
CPEB4Q17RY0 SSBP2-219ENST00000515395 1398 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.911e-8■■■■■ 55.4
CPEB4Q17RY0 SSBP2-205ENST00000505980 1521 ntTSL 2 BASIC8.31□□□□□ -1.081e-8■■■■■ 55.4
CPEB4Q17RY0 SSBP2-201ENST00000320672 8780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.121e-8■■■■■ 55.4
CPEB4Q17RY0 SSBP2-212ENST00000509053 1534 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.211e-8■■■■■ 55.4
CPEB4Q17RY0 SSBP2-211ENST00000509013 709 ntTSL 55.37□□□□□ -1.551e-8■■■■■ 55.4
CPEB4Q17RY0 SSBP2-206ENST00000506960 685 ntTSL 24.84□□□□□ -1.631e-8■■■■■ 55.4
CPEB4Q17RY0 SSBP2-210ENST00000508912 256 ntTSL 24.58□□□□□ -1.681e-8■■■■■ 55.4
CPEB4Q17RY0 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.099e-9■■■■■ 54.3
CPEB4Q17RY0 ZC3H11A-202ENST00000367210 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.49e-9■■■■■ 54.3
CPEB4Q17RY0 ZC3H11A-201ENST00000332127 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.469e-9■■■■■ 54.3
CPEB4Q17RY0 ZC3H11A-213ENST00000638800 7078 ntTSL 55.04□□□□□ -1.69e-9■■■■■ 54.3
CPEB4Q17RY0 ZBED6-202ENST00000550078 12481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.639e-9■■■■■ 54.3
CPEB4Q17RY0 ZBED6-201ENST00000545588 7979 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.659e-9■■■■■ 54.3
CPEB4Q17RY0 ZC3H11A-212ENST00000495527 8404 ntTSL 1 (best)4.7□□□□□ -1.669e-9■■■■■ 54.3
CPEB4Q17RY0 ZC3H11A-215ENST00000640465 4365 ntTSL 1 (best)3.84□□□□□ -1.89e-9■■■■■ 54.3
CPEB4Q17RY0 ZC3H11A-214ENST00000639812 11825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.89e-9■■■■■ 54.3
CPEB4Q17RY0 MYH9-201ENST00000216181 7501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.764e-12■■■■■ 52.3
CPEB4Q17RY0 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.141e-15■■■■■ 52.3
CPEB4Q17RY0 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.011e-15■■■■■ 52.3
CPEB4Q17RY0 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.011e-15■■■■■ 52.3
CPEB4Q17RY0 CCNG2-203ENST00000497512 2051 ntTSL 1 (best)24.72■■□□□ 1.551e-7■■■■■ 51.8
CPEB4Q17RY0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.971e-7■■■■■ 51.8
CPEB4Q17RY0 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.066e-8■■■■■ 50.8
CPEB4Q17RY0 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.056e-8■■■■■ 50.8
CPEB4Q17RY0 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.016e-8■■■■■ 50.8
CPEB4Q17RY0 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.036e-8■■■■■ 50.8
CPEB4Q17RY0 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.16e-8■■■■■ 50.8
CPEB4Q17RY0 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.236e-8■■■■■ 50.8
CPEB4Q17RY0 SMARCA4-219ENST00000592604 2940 ntTSL 1 (best)13.46□□□□□ -0.256e-8■■■■■ 50.8
CPEB4Q17RY0 CPSF1-206ENST00000531480 789 ntTSL 313.29□□□□□ -0.286e-8■■■■■ 50.8
CPEB4Q17RY0 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.286e-8■■■■■ 50.8
CPEB4Q17RY0 SMARCA4-212ENST00000586985 534 ntTSL 513.24□□□□□ -0.296e-8■■■■■ 50.8
CPEB4Q17RY0 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.356e-8■■■■■ 50.8
CPEB4Q17RY0 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.396e-8■■■■■ 50.8
CPEB4Q17RY0 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.436e-8■■■■■ 50.8
CPEB4Q17RY0 SMARCA4-205ENST00000450717 5506 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.56e-8■■■■■ 50.8
CPEB4Q17RY0 KDM2A-210ENST00000529006 6967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.596e-8■■■■■ 50.8
CPEB4Q17RY0 SMARCA4-208ENST00000585799 3842 ntTSL 211.3□□□□□ -0.66e-8■■■■■ 50.8
CPEB4Q17RY0 SMARCA4-211ENST00000586921 569 ntTSL 511.19□□□□□ -0.626e-8■■■■■ 50.8
CPEB4Q17RY0 SMARCA4-217ENST00000591595 3377 ntTSL 210.64□□□□□ -0.716e-8■■■■■ 50.8
CPEB4Q17RY0 STXBP5-204ENST00000367481 9177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.086e-8■■■■■ 50.8
CPEB4Q17RY0 STXBP5-202ENST00000367475 521 ntTSL 57.39□□□□□ -1.236e-8■■■■■ 50.8
CPEB4Q17RY0 STXBP5-201ENST00000321680 3456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.346e-8■■■■■ 50.8
CPEB4Q17RY0 STXBP5-203ENST00000367480 3297 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.356e-8■■■■■ 50.8
CPEB4Q17RY0 OSTC-205ENST00000613215 876 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.496e-8■■■■■ 50.8
CPEB4Q17RY0 STXBP5-205ENST00000392291 791 ntTSL 55.55□□□□□ -1.526e-8■■■■■ 50.8
CPEB4Q17RY0 MIR19A-201ENST00000384878 82 ntBASIC4.63□□□□□ -1.676e-8■■■■■ 50.8
CPEB4Q17RY0 FP236383.1-201ENST00000623860 2498 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.562e-42■■■■■ 50.3
CPEB4Q17RY0 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.362e-6■■■■■ 49.9
CPEB4Q17RY0 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.272e-6■■■■■ 49.9
CPEB4Q17RY0 ARHGEF18-203ENST00000594665 4616 ntTSL 216.03■□□□□ 0.162e-6■■■■■ 49.9
CPEB4Q17RY0 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.152e-6■■■■■ 49.9
CPEB4Q17RY0 FRYL-202ENST00000358350 11706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.442e-7■■■■■ 49.7
CPEB4Q17RY0 FRYL-211ENST00000507873 7031 ntTSL 1 (best)4.67□□□□□ -1.662e-7■■■■■ 49.7
CPEB4Q17RY0 FRYL-205ENST00000503238 11103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.852e-7■■■■■ 49.7
CPEB4Q17RY0 FRYL-206ENST00000503339 3482 ntTSL 23.26□□□□□ -1.892e-7■■■■■ 49.7
CPEB4Q17RY0 TXNIP-204ENST00000582401 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.352e-26■■■■■ 46.5
CPEB4Q17RY0 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.621e-8■■■■■ 46.2
CPEB4Q17RY0 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31e-8■■■■■ 46.2
CPEB4Q17RY0 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.071e-8■■■■■ 46.2
CPEB4Q17RY0 VEGFA-215ENST00000497139 2746 ntTSL 1 (best)11.46□□□□□ -0.581e-8■■■■■ 46.2
CPEB4Q17RY0 VEGFA-212ENST00000480614 12167 ntTSL 1 (best)8.84□□□□□ -11e-8■■■■■ 46.2
CPEB4Q17RY0 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.553e-7■■■■■ 46.2
CPEB4Q17RY0 ADORA2A-206ENST00000464977 558 ntTSL 424.12■■□□□ 1.453e-7■■■■■ 46.2
CPEB4Q17RY0 ADORA2A-205ENST00000444262 1517 ntTSL 520.75■□□□□ 0.913e-7■■■■■ 46.2
CPEB4Q17RY0 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.913e-7■■■■■ 46.2
CPEB4Q17RY0 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.653e-7■■■■■ 46.2
CPEB4Q17RY0 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.653e-7■■■■■ 46.2
CPEB4Q17RY0 ADORA2A-210ENST00000486351 578 ntTSL 418.51■□□□□ 0.553e-7■■■■■ 46.2
CPEB4Q17RY0 ADORA2A-209ENST00000486108 926 ntTSL 218.5■□□□□ 0.553e-7■■■■■ 46.2
CPEB4Q17RY0 ADORA2A-212ENST00000496497 691 ntTSL 218.32■□□□□ 0.523e-7■■■■■ 46.2
CPEB4Q17RY0 ADORA2A-211ENST00000496258 689 ntTSL 218.11■□□□□ 0.493e-7■■■■■ 46.2
CPEB4Q17RY0 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.43e-7■■■■■ 46.2
CPEB4Q17RY0 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.43e-7■■■■■ 46.2
CPEB4Q17RY0 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.43e-7■■■■■ 46.2
CPEB4Q17RY0 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.393e-7■■■■■ 46.2
CPEB4Q17RY0 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.353e-7■■■■■ 46.2
CPEB4Q17RY0 ADPGK-213ENST00000569534 2262 ntTSL 217.02■□□□□ 0.323e-7■■■■■ 46.2
CPEB4Q17RY0 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.283e-7■■■■■ 46.2
Retrieved 100 of 1,751 protein–RNA pairs in 308.4 ms