Protein–RNA interactions for Protein: Q16558

KCNMB1, Calcium-activated potassium channel subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB1Q16558 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
KCNMB1Q16558 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KCNMB1Q16558 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNMB1Q16558 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNMB1Q16558 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNMB1Q16558 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCNMB1Q16558 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KCNMB1Q16558 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNMB1Q16558 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNMB1Q16558 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNMB1Q16558 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNMB1Q16558 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNMB1Q16558 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNMB1Q16558 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KCNMB1Q16558 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KCNMB1Q16558 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KCNMB1Q16558 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KCNMB1Q16558 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KCNMB1Q16558 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KCNMB1Q16558 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KCNMB1Q16558 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KCNMB1Q16558 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KCNMB1Q16558 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
KCNMB1Q16558 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KCNMB1Q16558 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KCNMB1Q16558 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KCNMB1Q16558 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KCNMB1Q16558 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KCNMB1Q16558 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KCNMB1Q16558 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KCNMB1Q16558 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KCNMB1Q16558 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KCNMB1Q16558 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KCNMB1Q16558 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KCNMB1Q16558 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KCNMB1Q16558 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KCNMB1Q16558 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KCNMB1Q16558 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KCNMB1Q16558 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KCNMB1Q16558 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KCNMB1Q16558 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KCNMB1Q16558 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KCNMB1Q16558 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KCNMB1Q16558 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KCNMB1Q16558 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
KCNMB1Q16558 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KCNMB1Q16558 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KCNMB1Q16558 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KCNMB1Q16558 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KCNMB1Q16558 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KCNMB1Q16558 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KCNMB1Q16558 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KCNMB1Q16558 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KCNMB1Q16558 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KCNMB1Q16558 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KCNMB1Q16558 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KCNMB1Q16558 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KCNMB1Q16558 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCNMB1Q16558 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCNMB1Q16558 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KCNMB1Q16558 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KCNMB1Q16558 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KCNMB1Q16558 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KCNMB1Q16558 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KCNMB1Q16558 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
KCNMB1Q16558 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KCNMB1Q16558 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KCNMB1Q16558 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KCNMB1Q16558 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KCNMB1Q16558 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KCNMB1Q16558 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KCNMB1Q16558 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCNMB1Q16558 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCNMB1Q16558 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCNMB1Q16558 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KCNMB1Q16558 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KCNMB1Q16558 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KCNMB1Q16558 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KCNMB1Q16558 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KCNMB1Q16558 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KCNMB1Q16558 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KCNMB1Q16558 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KCNMB1Q16558 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KCNMB1Q16558 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
KCNMB1Q16558 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KCNMB1Q16558 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KCNMB1Q16558 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KCNMB1Q16558 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KCNMB1Q16558 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KCNMB1Q16558 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KCNMB1Q16558 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KCNMB1Q16558 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KCNMB1Q16558 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KCNMB1Q16558 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KCNMB1Q16558 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KCNMB1Q16558 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNMB1Q16558 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNMB1Q16558 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNMB1Q16558 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNMB1Q16558 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms