Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNXAQ16473 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNXAQ16473 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNXAQ16473 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNXAQ16473 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNXAQ16473 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TNXAQ16473 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNXAQ16473 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNXAQ16473 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNXAQ16473 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNXAQ16473 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNXAQ16473 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNXAQ16473 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNXAQ16473 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TNXAQ16473 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNXAQ16473 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNXAQ16473 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNXAQ16473 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNXAQ16473 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNXAQ16473 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNXAQ16473 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TNXAQ16473 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNXAQ16473 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNXAQ16473 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNXAQ16473 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNXAQ16473 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNXAQ16473 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNXAQ16473 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNXAQ16473 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNXAQ16473 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TNXAQ16473 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNXAQ16473 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNXAQ16473 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNXAQ16473 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TNXAQ16473 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TNXAQ16473 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNXAQ16473 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNXAQ16473 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNXAQ16473 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNXAQ16473 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNXAQ16473 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNXAQ16473 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNXAQ16473 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNXAQ16473 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNXAQ16473 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNXAQ16473 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNXAQ16473 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNXAQ16473 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNXAQ16473 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNXAQ16473 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNXAQ16473 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNXAQ16473 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNXAQ16473 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNXAQ16473 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNXAQ16473 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNXAQ16473 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNXAQ16473 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNXAQ16473 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNXAQ16473 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNXAQ16473 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNXAQ16473 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNXAQ16473 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNXAQ16473 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNXAQ16473 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNXAQ16473 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNXAQ16473 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNXAQ16473 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNXAQ16473 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNXAQ16473 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNXAQ16473 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNXAQ16473 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNXAQ16473 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNXAQ16473 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNXAQ16473 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNXAQ16473 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNXAQ16473 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNXAQ16473 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNXAQ16473 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNXAQ16473 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNXAQ16473 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNXAQ16473 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNXAQ16473 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNXAQ16473 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TNXAQ16473 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNXAQ16473 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNXAQ16473 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNXAQ16473 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNXAQ16473 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNXAQ16473 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNXAQ16473 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNXAQ16473 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNXAQ16473 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNXAQ16473 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNXAQ16473 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNXAQ16473 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNXAQ16473 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNXAQ16473 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNXAQ16473 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNXAQ16473 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TNXAQ16473 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms