Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.97■■■■□ 3.99
CHRNA2Q15822 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC39.96■■■■□ 3.99
CHRNA2Q15822 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
CHRNA2Q15822 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.92■■■■□ 3.98
CHRNA2Q15822 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.91■■■■□ 3.98
CHRNA2Q15822 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
CHRNA2Q15822 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC39.9■■■■□ 3.98
CHRNA2Q15822 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC39.9■■■■□ 3.98
CHRNA2Q15822 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC39.87■■■■□ 3.97
CHRNA2Q15822 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC39.83■■■■□ 3.97
CHRNA2Q15822 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC39.82■■■■□ 3.97
CHRNA2Q15822 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.97
CHRNA2Q15822 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC39.82■■■■□ 3.96
CHRNA2Q15822 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.81■■■■□ 3.96
CHRNA2Q15822 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC39.77■■■■□ 3.96
CHRNA2Q15822 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC39.72■■■■□ 3.95
CHRNA2Q15822 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC39.72■■■■□ 3.95
CHRNA2Q15822 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC39.71■■■■□ 3.95
CHRNA2Q15822 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
CHRNA2Q15822 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
CHRNA2Q15822 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
CHRNA2Q15822 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
CHRNA2Q15822 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC39.49■■■■□ 3.91
CHRNA2Q15822 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.44■■■■□ 3.9
CHRNA2Q15822 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.44■■■■□ 3.9
CHRNA2Q15822 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
CHRNA2Q15822 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC39.41■■■■□ 3.9
CHRNA2Q15822 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC39.37■■■■□ 3.89
CHRNA2Q15822 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC39.36■■■■□ 3.89
CHRNA2Q15822 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
CHRNA2Q15822 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC39.31■■■■□ 3.88
CHRNA2Q15822 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
CHRNA2Q15822 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
CHRNA2Q15822 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC39.31■■■■□ 3.88
CHRNA2Q15822 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
CHRNA2Q15822 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC39.28■■■■□ 3.88
CHRNA2Q15822 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC39.26■■■■□ 3.88
CHRNA2Q15822 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC39.24■■■■□ 3.87
CHRNA2Q15822 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC39.21■■■■□ 3.87
CHRNA2Q15822 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
CHRNA2Q15822 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
CHRNA2Q15822 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
CHRNA2Q15822 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC39.15■■■■□ 3.86
CHRNA2Q15822 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC39.15■■■■□ 3.86
CHRNA2Q15822 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC39.13■■■■□ 3.85
CHRNA2Q15822 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC39.12■■■■□ 3.85
CHRNA2Q15822 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
CHRNA2Q15822 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
CHRNA2Q15822 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.06■■■■□ 3.84
CHRNA2Q15822 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC39.05■■■■□ 3.84
CHRNA2Q15822 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
CHRNA2Q15822 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.03■■■■□ 3.84
CHRNA2Q15822 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
CHRNA2Q15822 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39■■■■□ 3.83
CHRNA2Q15822 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC38.99■■■■□ 3.83
CHRNA2Q15822 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
CHRNA2Q15822 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC38.95■■■■□ 3.83
CHRNA2Q15822 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
CHRNA2Q15822 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC38.89■■■■□ 3.82
CHRNA2Q15822 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
CHRNA2Q15822 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.85■■■■□ 3.81
CHRNA2Q15822 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
CHRNA2Q15822 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC38.83■■■■□ 3.81
CHRNA2Q15822 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
CHRNA2Q15822 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC38.7■■■■□ 3.79
CHRNA2Q15822 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC38.69■■■■□ 3.78
CHRNA2Q15822 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC38.68■■■■□ 3.78
CHRNA2Q15822 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.66■■■■□ 3.78
CHRNA2Q15822 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.65■■■■□ 3.78
CHRNA2Q15822 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
CHRNA2Q15822 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
CHRNA2Q15822 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC38.6■■■■□ 3.77
CHRNA2Q15822 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC38.6■■■■□ 3.77
CHRNA2Q15822 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC38.59■■■■□ 3.77
CHRNA2Q15822 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.76
CHRNA2Q15822 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC38.56■■■■□ 3.76
CHRNA2Q15822 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
CHRNA2Q15822 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
CHRNA2Q15822 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC38.54■■■■□ 3.76
CHRNA2Q15822 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
CHRNA2Q15822 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC38.52■■■■□ 3.76
CHRNA2Q15822 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC38.48■■■■□ 3.75
CHRNA2Q15822 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC38.48■■■■□ 3.75
CHRNA2Q15822 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
CHRNA2Q15822 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC38.44■■■■□ 3.74
CHRNA2Q15822 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
CHRNA2Q15822 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC38.4■■■■□ 3.74
CHRNA2Q15822 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
CHRNA2Q15822 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
CHRNA2Q15822 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
CHRNA2Q15822 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
CHRNA2Q15822 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
CHRNA2Q15822 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC38.33■■■■□ 3.73
CHRNA2Q15822 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC38.33■■■■□ 3.73
CHRNA2Q15822 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC38.33■■■■□ 3.73
CHRNA2Q15822 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
CHRNA2Q15822 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.32■■■■□ 3.72
CHRNA2Q15822 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC38.32■■■■□ 3.72
CHRNA2Q15822 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
CHRNA2Q15822 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms