Protein–RNA interactions for Protein: Q15714

TSC22D1, TSC22 domain family protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,073 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSC22D1Q15714 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TSC22D1Q15714 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TSC22D1Q15714 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TSC22D1Q15714 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TSC22D1Q15714 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TSC22D1Q15714 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TSC22D1Q15714 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
TSC22D1Q15714 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TSC22D1Q15714 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TSC22D1Q15714 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TSC22D1Q15714 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TSC22D1Q15714 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TSC22D1Q15714 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TSC22D1Q15714 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TSC22D1Q15714 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TSC22D1Q15714 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TSC22D1Q15714 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TSC22D1Q15714 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TSC22D1Q15714 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TSC22D1Q15714 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TSC22D1Q15714 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TSC22D1Q15714 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TSC22D1Q15714 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TSC22D1Q15714 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TSC22D1Q15714 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TSC22D1Q15714 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TSC22D1Q15714 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TSC22D1Q15714 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TSC22D1Q15714 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TSC22D1Q15714 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TSC22D1Q15714 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TSC22D1Q15714 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TSC22D1Q15714 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TSC22D1Q15714 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TSC22D1Q15714 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TSC22D1Q15714 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TSC22D1Q15714 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TSC22D1Q15714 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TSC22D1Q15714 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TSC22D1Q15714 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TSC22D1Q15714 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TSC22D1Q15714 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TSC22D1Q15714 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TSC22D1Q15714 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TSC22D1Q15714 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TSC22D1Q15714 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TSC22D1Q15714 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TSC22D1Q15714 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TSC22D1Q15714 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TSC22D1Q15714 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TSC22D1Q15714 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TSC22D1Q15714 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TSC22D1Q15714 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TSC22D1Q15714 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
TSC22D1Q15714 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TSC22D1Q15714 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TSC22D1Q15714 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TSC22D1Q15714 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TSC22D1Q15714 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TSC22D1Q15714 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TSC22D1Q15714 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TSC22D1Q15714 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TSC22D1Q15714 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TSC22D1Q15714 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TSC22D1Q15714 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TSC22D1Q15714 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TSC22D1Q15714 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TSC22D1Q15714 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TSC22D1Q15714 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TSC22D1Q15714 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TSC22D1Q15714 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TSC22D1Q15714 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TSC22D1Q15714 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TSC22D1Q15714 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TSC22D1Q15714 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TSC22D1Q15714 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TSC22D1Q15714 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TSC22D1Q15714 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TSC22D1Q15714 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TSC22D1Q15714 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TSC22D1Q15714 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TSC22D1Q15714 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TSC22D1Q15714 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TSC22D1Q15714 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TSC22D1Q15714 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TSC22D1Q15714 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TSC22D1Q15714 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TSC22D1Q15714 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TSC22D1Q15714 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TSC22D1Q15714 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TSC22D1Q15714 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TSC22D1Q15714 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TSC22D1Q15714 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TSC22D1Q15714 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TSC22D1Q15714 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TSC22D1Q15714 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TSC22D1Q15714 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TSC22D1Q15714 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TSC22D1Q15714 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TSC22D1Q15714 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
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