Protein–RNA interactions for Protein: Q15067

ACOX1, Peroxisomal acyl-coenzyme A oxidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACOX1Q15067 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ACOX1Q15067 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ACOX1Q15067 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
ACOX1Q15067 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ACOX1Q15067 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ACOX1Q15067 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ACOX1Q15067 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
ACOX1Q15067 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ACOX1Q15067 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
ACOX1Q15067 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ACOX1Q15067 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ACOX1Q15067 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ACOX1Q15067 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ACOX1Q15067 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ACOX1Q15067 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ACOX1Q15067 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ACOX1Q15067 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ACOX1Q15067 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ACOX1Q15067 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ACOX1Q15067 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ACOX1Q15067 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ACOX1Q15067 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ACOX1Q15067 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ACOX1Q15067 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ACOX1Q15067 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ACOX1Q15067 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ACOX1Q15067 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ACOX1Q15067 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ACOX1Q15067 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ACOX1Q15067 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ACOX1Q15067 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ACOX1Q15067 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ACOX1Q15067 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
ACOX1Q15067 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ACOX1Q15067 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ACOX1Q15067 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ACOX1Q15067 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ACOX1Q15067 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ACOX1Q15067 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ACOX1Q15067 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ACOX1Q15067 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ACOX1Q15067 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ACOX1Q15067 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ACOX1Q15067 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ACOX1Q15067 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ACOX1Q15067 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
ACOX1Q15067 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ACOX1Q15067 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ACOX1Q15067 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ACOX1Q15067 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ACOX1Q15067 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ACOX1Q15067 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ACOX1Q15067 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ACOX1Q15067 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ACOX1Q15067 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ACOX1Q15067 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ACOX1Q15067 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ACOX1Q15067 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ACOX1Q15067 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ACOX1Q15067 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ACOX1Q15067 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ACOX1Q15067 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ACOX1Q15067 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ACOX1Q15067 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ACOX1Q15067 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ACOX1Q15067 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ACOX1Q15067 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ACOX1Q15067 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ACOX1Q15067 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ACOX1Q15067 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ACOX1Q15067 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ACOX1Q15067 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ACOX1Q15067 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.08
ACOX1Q15067 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ACOX1Q15067 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ACOX1Q15067 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ACOX1Q15067 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ACOX1Q15067 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ACOX1Q15067 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
ACOX1Q15067 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ACOX1Q15067 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ACOX1Q15067 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ACOX1Q15067 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ACOX1Q15067 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ACOX1Q15067 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ACOX1Q15067 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ACOX1Q15067 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ACOX1Q15067 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ACOX1Q15067 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ACOX1Q15067 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ACOX1Q15067 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ACOX1Q15067 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ACOX1Q15067 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ACOX1Q15067 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ACOX1Q15067 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ACOX1Q15067 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ACOX1Q15067 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ACOX1Q15067 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ACOX1Q15067 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ACOX1Q15067 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms