Protein–RNA interactions for Protein: Q14994

NR1I3, Nuclear receptor subfamily 1 group I member 3, humanhuman

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Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1I3Q14994 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
NR1I3Q14994 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
NR1I3Q14994 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
NR1I3Q14994 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
NR1I3Q14994 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
NR1I3Q14994 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
NR1I3Q14994 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
NR1I3Q14994 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
NR1I3Q14994 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
NR1I3Q14994 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
NR1I3Q14994 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
NR1I3Q14994 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
NR1I3Q14994 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
NR1I3Q14994 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
NR1I3Q14994 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
NR1I3Q14994 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
NR1I3Q14994 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC31.48■■■□□ 2.63
NR1I3Q14994 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC31.47■■■□□ 2.63
NR1I3Q14994 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
NR1I3Q14994 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
NR1I3Q14994 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
NR1I3Q14994 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.43■■■□□ 2.62
NR1I3Q14994 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
NR1I3Q14994 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC31.42■■■□□ 2.62
NR1I3Q14994 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
NR1I3Q14994 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
NR1I3Q14994 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
NR1I3Q14994 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.61
NR1I3Q14994 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.61
NR1I3Q14994 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
NR1I3Q14994 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
NR1I3Q14994 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
NR1I3Q14994 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
NR1I3Q14994 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
NR1I3Q14994 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
NR1I3Q14994 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
NR1I3Q14994 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
NR1I3Q14994 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
NR1I3Q14994 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
NR1I3Q14994 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
NR1I3Q14994 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
NR1I3Q14994 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
NR1I3Q14994 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
NR1I3Q14994 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
NR1I3Q14994 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
NR1I3Q14994 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
NR1I3Q14994 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
NR1I3Q14994 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
NR1I3Q14994 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC31.16■■■□□ 2.58
NR1I3Q14994 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
NR1I3Q14994 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
NR1I3Q14994 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
NR1I3Q14994 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
NR1I3Q14994 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
NR1I3Q14994 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
NR1I3Q14994 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
NR1I3Q14994 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
NR1I3Q14994 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
NR1I3Q14994 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
NR1I3Q14994 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.56
NR1I3Q14994 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
NR1I3Q14994 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
NR1I3Q14994 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
NR1I3Q14994 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
NR1I3Q14994 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
NR1I3Q14994 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
NR1I3Q14994 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC30.98■■■□□ 2.55
NR1I3Q14994 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
NR1I3Q14994 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
NR1I3Q14994 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
NR1I3Q14994 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
NR1I3Q14994 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
NR1I3Q14994 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
NR1I3Q14994 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
NR1I3Q14994 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.53
NR1I3Q14994 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
NR1I3Q14994 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
NR1I3Q14994 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
NR1I3Q14994 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
NR1I3Q14994 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
NR1I3Q14994 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
NR1I3Q14994 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
NR1I3Q14994 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
NR1I3Q14994 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
NR1I3Q14994 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC30.83■■■□□ 2.53
NR1I3Q14994 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
NR1I3Q14994 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
NR1I3Q14994 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
NR1I3Q14994 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
NR1I3Q14994 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC30.77■■■□□ 2.52
NR1I3Q14994 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
NR1I3Q14994 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
NR1I3Q14994 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
NR1I3Q14994 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
NR1I3Q14994 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
NR1I3Q14994 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
NR1I3Q14994 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
NR1I3Q14994 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC30.65■■■□□ 2.5
NR1I3Q14994 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
NR1I3Q14994 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
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