Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMCO1Q147U7 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMCO1Q147U7 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMCO1Q147U7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMCO1Q147U7 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMCO1Q147U7 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMCO1Q147U7 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMCO1Q147U7 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMCO1Q147U7 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMCO1Q147U7 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMCO1Q147U7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMCO1Q147U7 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMCO1Q147U7 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMCO1Q147U7 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMCO1Q147U7 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMCO1Q147U7 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMCO1Q147U7 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMCO1Q147U7 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMCO1Q147U7 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMCO1Q147U7 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMCO1Q147U7 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMCO1Q147U7 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMCO1Q147U7 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMCO1Q147U7 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMCO1Q147U7 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SMCO1Q147U7 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SMCO1Q147U7 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMCO1Q147U7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMCO1Q147U7 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMCO1Q147U7 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMCO1Q147U7 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMCO1Q147U7 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMCO1Q147U7 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMCO1Q147U7 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMCO1Q147U7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMCO1Q147U7 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMCO1Q147U7 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMCO1Q147U7 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMCO1Q147U7 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMCO1Q147U7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMCO1Q147U7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMCO1Q147U7 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMCO1Q147U7 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMCO1Q147U7 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMCO1Q147U7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMCO1Q147U7 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SMCO1Q147U7 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMCO1Q147U7 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMCO1Q147U7 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMCO1Q147U7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMCO1Q147U7 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SMCO1Q147U7 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMCO1Q147U7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMCO1Q147U7 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMCO1Q147U7 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SMCO1Q147U7 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMCO1Q147U7 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMCO1Q147U7 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMCO1Q147U7 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMCO1Q147U7 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMCO1Q147U7 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMCO1Q147U7 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMCO1Q147U7 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMCO1Q147U7 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMCO1Q147U7 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMCO1Q147U7 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMCO1Q147U7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMCO1Q147U7 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMCO1Q147U7 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMCO1Q147U7 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMCO1Q147U7 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMCO1Q147U7 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SMCO1Q147U7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMCO1Q147U7 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMCO1Q147U7 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMCO1Q147U7 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMCO1Q147U7 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMCO1Q147U7 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMCO1Q147U7 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMCO1Q147U7 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMCO1Q147U7 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMCO1Q147U7 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMCO1Q147U7 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMCO1Q147U7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMCO1Q147U7 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMCO1Q147U7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMCO1Q147U7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMCO1Q147U7 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMCO1Q147U7 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMCO1Q147U7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMCO1Q147U7 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMCO1Q147U7 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMCO1Q147U7 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMCO1Q147U7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMCO1Q147U7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMCO1Q147U7 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMCO1Q147U7 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMCO1Q147U7 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMCO1Q147U7 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMCO1Q147U7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
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