Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CUL4AQ13619 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
CUL4AQ13619 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CUL4AQ13619 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
CUL4AQ13619 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
CUL4AQ13619 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
CUL4AQ13619 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC33.91■■■■□ 3.02
CUL4AQ13619 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
CUL4AQ13619 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
CUL4AQ13619 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CUL4AQ13619 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
CUL4AQ13619 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
CUL4AQ13619 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
CUL4AQ13619 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
CUL4AQ13619 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
CUL4AQ13619 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CUL4AQ13619 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CUL4AQ13619 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
CUL4AQ13619 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
CUL4AQ13619 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
CUL4AQ13619 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
CUL4AQ13619 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
CUL4AQ13619 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
CUL4AQ13619 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
CUL4AQ13619 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
CUL4AQ13619 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.67■■■□□ 2.98
CUL4AQ13619 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
CUL4AQ13619 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
CUL4AQ13619 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
CUL4AQ13619 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
CUL4AQ13619 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
CUL4AQ13619 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
CUL4AQ13619 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
CUL4AQ13619 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
CUL4AQ13619 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
CUL4AQ13619 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
CUL4AQ13619 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
CUL4AQ13619 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
CUL4AQ13619 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
CUL4AQ13619 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
CUL4AQ13619 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
CUL4AQ13619 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
CUL4AQ13619 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
CUL4AQ13619 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
CUL4AQ13619 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
CUL4AQ13619 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
CUL4AQ13619 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CUL4AQ13619 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CUL4AQ13619 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
CUL4AQ13619 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CUL4AQ13619 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
CUL4AQ13619 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
CUL4AQ13619 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
CUL4AQ13619 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
CUL4AQ13619 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC33.34■■■□□ 2.93
CUL4AQ13619 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
CUL4AQ13619 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CUL4AQ13619 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CUL4AQ13619 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CUL4AQ13619 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
CUL4AQ13619 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.92
CUL4AQ13619 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CUL4AQ13619 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CUL4AQ13619 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CUL4AQ13619 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CUL4AQ13619 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
CUL4AQ13619 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
CUL4AQ13619 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
CUL4AQ13619 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CUL4AQ13619 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CUL4AQ13619 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
CUL4AQ13619 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
CUL4AQ13619 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
CUL4AQ13619 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
CUL4AQ13619 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
CUL4AQ13619 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
CUL4AQ13619 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
CUL4AQ13619 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
CUL4AQ13619 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC33.1■■■□□ 2.89
CUL4AQ13619 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
CUL4AQ13619 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
CUL4AQ13619 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC33.04■■■□□ 2.88
CUL4AQ13619 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
CUL4AQ13619 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
CUL4AQ13619 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
CUL4AQ13619 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC33.01■■■□□ 2.88
CUL4AQ13619 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
CUL4AQ13619 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
CUL4AQ13619 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
CUL4AQ13619 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC33■■■□□ 2.87
CUL4AQ13619 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC32.99■■■□□ 2.87
CUL4AQ13619 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
CUL4AQ13619 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
CUL4AQ13619 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
CUL4AQ13619 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
CUL4AQ13619 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
CUL4AQ13619 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
CUL4AQ13619 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
CUL4AQ13619 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
CUL4AQ13619 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.85
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