Protein–RNA interactions for Protein: Q13609

DNASE1L3, Deoxyribonuclease gamma, humanhuman

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Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNASE1L3Q13609 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
DNASE1L3Q13609 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
DNASE1L3Q13609 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
DNASE1L3Q13609 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
DNASE1L3Q13609 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
DNASE1L3Q13609 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DNASE1L3Q13609 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
DNASE1L3Q13609 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
DNASE1L3Q13609 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
DNASE1L3Q13609 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
DNASE1L3Q13609 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
DNASE1L3Q13609 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
DNASE1L3Q13609 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
DNASE1L3Q13609 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
DNASE1L3Q13609 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
DNASE1L3Q13609 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
DNASE1L3Q13609 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
DNASE1L3Q13609 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
DNASE1L3Q13609 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
DNASE1L3Q13609 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
DNASE1L3Q13609 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
DNASE1L3Q13609 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
DNASE1L3Q13609 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
DNASE1L3Q13609 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
DNASE1L3Q13609 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
DNASE1L3Q13609 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
DNASE1L3Q13609 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
DNASE1L3Q13609 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
DNASE1L3Q13609 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
DNASE1L3Q13609 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
DNASE1L3Q13609 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
DNASE1L3Q13609 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
DNASE1L3Q13609 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
DNASE1L3Q13609 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
DNASE1L3Q13609 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
DNASE1L3Q13609 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
DNASE1L3Q13609 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
DNASE1L3Q13609 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
DNASE1L3Q13609 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
DNASE1L3Q13609 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
DNASE1L3Q13609 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
DNASE1L3Q13609 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
DNASE1L3Q13609 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
DNASE1L3Q13609 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
DNASE1L3Q13609 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
DNASE1L3Q13609 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
DNASE1L3Q13609 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
DNASE1L3Q13609 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
DNASE1L3Q13609 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
DNASE1L3Q13609 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
DNASE1L3Q13609 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
DNASE1L3Q13609 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
DNASE1L3Q13609 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
DNASE1L3Q13609 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
DNASE1L3Q13609 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
DNASE1L3Q13609 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
DNASE1L3Q13609 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
DNASE1L3Q13609 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
DNASE1L3Q13609 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
DNASE1L3Q13609 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
DNASE1L3Q13609 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
DNASE1L3Q13609 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
DNASE1L3Q13609 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
DNASE1L3Q13609 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
DNASE1L3Q13609 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
DNASE1L3Q13609 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
DNASE1L3Q13609 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
DNASE1L3Q13609 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
DNASE1L3Q13609 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
DNASE1L3Q13609 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
DNASE1L3Q13609 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
DNASE1L3Q13609 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
DNASE1L3Q13609 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
DNASE1L3Q13609 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
DNASE1L3Q13609 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
DNASE1L3Q13609 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
DNASE1L3Q13609 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
DNASE1L3Q13609 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
DNASE1L3Q13609 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
DNASE1L3Q13609 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
DNASE1L3Q13609 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DNASE1L3Q13609 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
DNASE1L3Q13609 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
DNASE1L3Q13609 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
DNASE1L3Q13609 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
DNASE1L3Q13609 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
DNASE1L3Q13609 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
DNASE1L3Q13609 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
DNASE1L3Q13609 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
DNASE1L3Q13609 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
DNASE1L3Q13609 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
DNASE1L3Q13609 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
DNASE1L3Q13609 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
DNASE1L3Q13609 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
DNASE1L3Q13609 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
DNASE1L3Q13609 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
DNASE1L3Q13609 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
DNASE1L3Q13609 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
DNASE1L3Q13609 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
DNASE1L3Q13609 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
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