Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOXE3Q13461 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOXE3Q13461 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOXE3Q13461 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOXE3Q13461 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOXE3Q13461 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOXE3Q13461 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXE3Q13461 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXE3Q13461 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXE3Q13461 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXE3Q13461 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXE3Q13461 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXE3Q13461 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOXE3Q13461 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOXE3Q13461 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOXE3Q13461 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXE3Q13461 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXE3Q13461 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXE3Q13461 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOXE3Q13461 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
FOXE3Q13461 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXE3Q13461 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXE3Q13461 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FOXE3Q13461 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FOXE3Q13461 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FOXE3Q13461 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXE3Q13461 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXE3Q13461 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXE3Q13461 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXE3Q13461 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXE3Q13461 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FOXE3Q13461 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOXE3Q13461 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOXE3Q13461 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
FOXE3Q13461 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXE3Q13461 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXE3Q13461 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXE3Q13461 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FOXE3Q13461 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXE3Q13461 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXE3Q13461 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXE3Q13461 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXE3Q13461 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXE3Q13461 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXE3Q13461 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXE3Q13461 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXE3Q13461 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXE3Q13461 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXE3Q13461 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXE3Q13461 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXE3Q13461 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXE3Q13461 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOXE3Q13461 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOXE3Q13461 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXE3Q13461 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXE3Q13461 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXE3Q13461 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXE3Q13461 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXE3Q13461 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXE3Q13461 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXE3Q13461 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXE3Q13461 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXE3Q13461 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOXE3Q13461 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXE3Q13461 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXE3Q13461 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXE3Q13461 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXE3Q13461 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXE3Q13461 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXE3Q13461 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXE3Q13461 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXE3Q13461 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOXE3Q13461 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOXE3Q13461 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FOXE3Q13461 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXE3Q13461 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXE3Q13461 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXE3Q13461 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FOXE3Q13461 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FOXE3Q13461 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
FOXE3Q13461 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FOXE3Q13461 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FOXE3Q13461 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FOXE3Q13461 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FOXE3Q13461 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FOXE3Q13461 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FOXE3Q13461 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FOXE3Q13461 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FOXE3Q13461 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOXE3Q13461 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXE3Q13461 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXE3Q13461 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXE3Q13461 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FOXE3Q13461 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FOXE3Q13461 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FOXE3Q13461 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FOXE3Q13461 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FOXE3Q13461 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FOXE3Q13461 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FOXE3Q13461 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
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