Protein–RNA interactions for Protein: Q13404

UBE2V1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2V1Q13404 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
UBE2V1Q13404 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
UBE2V1Q13404 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBE2V1Q13404 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBE2V1Q13404 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBE2V1Q13404 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBE2V1Q13404 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBE2V1Q13404 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBE2V1Q13404 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBE2V1Q13404 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBE2V1Q13404 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBE2V1Q13404 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBE2V1Q13404 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBE2V1Q13404 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBE2V1Q13404 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBE2V1Q13404 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
UBE2V1Q13404 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBE2V1Q13404 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
UBE2V1Q13404 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
UBE2V1Q13404 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
UBE2V1Q13404 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
UBE2V1Q13404 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBE2V1Q13404 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBE2V1Q13404 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBE2V1Q13404 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
UBE2V1Q13404 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
UBE2V1Q13404 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
UBE2V1Q13404 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
UBE2V1Q13404 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
UBE2V1Q13404 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
UBE2V1Q13404 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
UBE2V1Q13404 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
UBE2V1Q13404 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
UBE2V1Q13404 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
UBE2V1Q13404 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
UBE2V1Q13404 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
UBE2V1Q13404 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
UBE2V1Q13404 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
UBE2V1Q13404 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
UBE2V1Q13404 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
UBE2V1Q13404 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UBE2V1Q13404 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UBE2V1Q13404 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBE2V1Q13404 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBE2V1Q13404 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBE2V1Q13404 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBE2V1Q13404 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBE2V1Q13404 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBE2V1Q13404 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBE2V1Q13404 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBE2V1Q13404 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBE2V1Q13404 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBE2V1Q13404 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
UBE2V1Q13404 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
UBE2V1Q13404 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
UBE2V1Q13404 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBE2V1Q13404 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBE2V1Q13404 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBE2V1Q13404 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBE2V1Q13404 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBE2V1Q13404 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBE2V1Q13404 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBE2V1Q13404 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBE2V1Q13404 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBE2V1Q13404 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBE2V1Q13404 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBE2V1Q13404 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBE2V1Q13404 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBE2V1Q13404 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBE2V1Q13404 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBE2V1Q13404 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBE2V1Q13404 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBE2V1Q13404 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBE2V1Q13404 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBE2V1Q13404 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBE2V1Q13404 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
UBE2V1Q13404 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
UBE2V1Q13404 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
UBE2V1Q13404 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
UBE2V1Q13404 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
UBE2V1Q13404 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
UBE2V1Q13404 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
UBE2V1Q13404 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
UBE2V1Q13404 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
UBE2V1Q13404 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBE2V1Q13404 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
UBE2V1Q13404 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
UBE2V1Q13404 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
UBE2V1Q13404 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
UBE2V1Q13404 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
UBE2V1Q13404 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
UBE2V1Q13404 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
UBE2V1Q13404 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
UBE2V1Q13404 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
UBE2V1Q13404 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
UBE2V1Q13404 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
UBE2V1Q13404 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
UBE2V1Q13404 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
UBE2V1Q13404 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
UBE2V1Q13404 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
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