Protein–RNA interactions for Protein: Q13404

UBE2V1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2V1Q13404 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
UBE2V1Q13404 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
UBE2V1Q13404 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBE2V1Q13404 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBE2V1Q13404 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBE2V1Q13404 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBE2V1Q13404 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBE2V1Q13404 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBE2V1Q13404 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBE2V1Q13404 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBE2V1Q13404 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBE2V1Q13404 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBE2V1Q13404 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBE2V1Q13404 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBE2V1Q13404 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBE2V1Q13404 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
UBE2V1Q13404 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBE2V1Q13404 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
UBE2V1Q13404 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
UBE2V1Q13404 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
UBE2V1Q13404 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
UBE2V1Q13404 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBE2V1Q13404 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBE2V1Q13404 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBE2V1Q13404 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
UBE2V1Q13404 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
UBE2V1Q13404 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
UBE2V1Q13404 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
UBE2V1Q13404 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
UBE2V1Q13404 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
UBE2V1Q13404 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
UBE2V1Q13404 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
UBE2V1Q13404 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
UBE2V1Q13404 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
UBE2V1Q13404 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
UBE2V1Q13404 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
UBE2V1Q13404 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
UBE2V1Q13404 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
UBE2V1Q13404 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
UBE2V1Q13404 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
UBE2V1Q13404 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UBE2V1Q13404 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UBE2V1Q13404 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBE2V1Q13404 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBE2V1Q13404 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBE2V1Q13404 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBE2V1Q13404 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBE2V1Q13404 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBE2V1Q13404 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBE2V1Q13404 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBE2V1Q13404 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBE2V1Q13404 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBE2V1Q13404 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
UBE2V1Q13404 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
UBE2V1Q13404 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
UBE2V1Q13404 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBE2V1Q13404 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBE2V1Q13404 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBE2V1Q13404 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBE2V1Q13404 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBE2V1Q13404 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBE2V1Q13404 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBE2V1Q13404 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBE2V1Q13404 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBE2V1Q13404 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBE2V1Q13404 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBE2V1Q13404 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBE2V1Q13404 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBE2V1Q13404 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBE2V1Q13404 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBE2V1Q13404 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBE2V1Q13404 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBE2V1Q13404 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBE2V1Q13404 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBE2V1Q13404 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBE2V1Q13404 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
UBE2V1Q13404 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
UBE2V1Q13404 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
UBE2V1Q13404 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
UBE2V1Q13404 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
UBE2V1Q13404 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
UBE2V1Q13404 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
UBE2V1Q13404 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
UBE2V1Q13404 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
UBE2V1Q13404 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBE2V1Q13404 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
UBE2V1Q13404 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
UBE2V1Q13404 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
UBE2V1Q13404 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
UBE2V1Q13404 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
UBE2V1Q13404 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
UBE2V1Q13404 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
UBE2V1Q13404 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
UBE2V1Q13404 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
UBE2V1Q13404 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
UBE2V1Q13404 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
UBE2V1Q13404 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
UBE2V1Q13404 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
UBE2V1Q13404 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
UBE2V1Q13404 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms