Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CLN3Q13286 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CLN3Q13286 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CLN3Q13286 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CLN3Q13286 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CLN3Q13286 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CLN3Q13286 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CLN3Q13286 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CLN3Q13286 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CLN3Q13286 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CLN3Q13286 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CLN3Q13286 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CLN3Q13286 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CLN3Q13286 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CLN3Q13286 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
CLN3Q13286 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CLN3Q13286 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CLN3Q13286 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CLN3Q13286 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CLN3Q13286 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
CLN3Q13286 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CLN3Q13286 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CLN3Q13286 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CLN3Q13286 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
CLN3Q13286 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CLN3Q13286 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CLN3Q13286 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CLN3Q13286 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CLN3Q13286 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CLN3Q13286 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CLN3Q13286 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CLN3Q13286 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CLN3Q13286 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CLN3Q13286 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CLN3Q13286 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CLN3Q13286 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CLN3Q13286 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CLN3Q13286 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CLN3Q13286 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CLN3Q13286 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CLN3Q13286 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CLN3Q13286 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CLN3Q13286 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
CLN3Q13286 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CLN3Q13286 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CLN3Q13286 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CLN3Q13286 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CLN3Q13286 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CLN3Q13286 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CLN3Q13286 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CLN3Q13286 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CLN3Q13286 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CLN3Q13286 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CLN3Q13286 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CLN3Q13286 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CLN3Q13286 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CLN3Q13286 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CLN3Q13286 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CLN3Q13286 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CLN3Q13286 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CLN3Q13286 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CLN3Q13286 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CLN3Q13286 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLN3Q13286 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CLN3Q13286 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CLN3Q13286 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CLN3Q13286 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CLN3Q13286 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CLN3Q13286 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CLN3Q13286 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CLN3Q13286 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CLN3Q13286 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CLN3Q13286 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CLN3Q13286 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CLN3Q13286 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CLN3Q13286 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CLN3Q13286 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CLN3Q13286 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CLN3Q13286 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CLN3Q13286 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CLN3Q13286 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CLN3Q13286 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CLN3Q13286 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CLN3Q13286 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CLN3Q13286 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CLN3Q13286 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CLN3Q13286 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLN3Q13286 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLN3Q13286 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CLN3Q13286 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLN3Q13286 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CLN3Q13286 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CLN3Q13286 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLN3Q13286 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLN3Q13286 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CLN3Q13286 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CLN3Q13286 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CLN3Q13286 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CLN3Q13286 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CLN3Q13286 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
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