Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NPRL3Q12980 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NPRL3Q12980 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NPRL3Q12980 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NPRL3Q12980 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NPRL3Q12980 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NPRL3Q12980 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NPRL3Q12980 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NPRL3Q12980 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NPRL3Q12980 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NPRL3Q12980 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NPRL3Q12980 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NPRL3Q12980 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
NPRL3Q12980 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NPRL3Q12980 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NPRL3Q12980 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NPRL3Q12980 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NPRL3Q12980 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NPRL3Q12980 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NPRL3Q12980 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NPRL3Q12980 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NPRL3Q12980 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NPRL3Q12980 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NPRL3Q12980 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NPRL3Q12980 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NPRL3Q12980 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NPRL3Q12980 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NPRL3Q12980 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NPRL3Q12980 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NPRL3Q12980 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NPRL3Q12980 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NPRL3Q12980 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NPRL3Q12980 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NPRL3Q12980 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NPRL3Q12980 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NPRL3Q12980 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NPRL3Q12980 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NPRL3Q12980 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NPRL3Q12980 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NPRL3Q12980 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NPRL3Q12980 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NPRL3Q12980 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NPRL3Q12980 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
NPRL3Q12980 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NPRL3Q12980 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NPRL3Q12980 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NPRL3Q12980 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NPRL3Q12980 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NPRL3Q12980 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
NPRL3Q12980 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NPRL3Q12980 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NPRL3Q12980 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NPRL3Q12980 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NPRL3Q12980 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NPRL3Q12980 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NPRL3Q12980 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NPRL3Q12980 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NPRL3Q12980 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NPRL3Q12980 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NPRL3Q12980 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NPRL3Q12980 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NPRL3Q12980 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NPRL3Q12980 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NPRL3Q12980 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NPRL3Q12980 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NPRL3Q12980 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NPRL3Q12980 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
NPRL3Q12980 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NPRL3Q12980 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NPRL3Q12980 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NPRL3Q12980 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NPRL3Q12980 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
NPRL3Q12980 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NPRL3Q12980 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NPRL3Q12980 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NPRL3Q12980 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NPRL3Q12980 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NPRL3Q12980 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NPRL3Q12980 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NPRL3Q12980 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NPRL3Q12980 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NPRL3Q12980 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NPRL3Q12980 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NPRL3Q12980 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NPRL3Q12980 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NPRL3Q12980 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NPRL3Q12980 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NPRL3Q12980 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NPRL3Q12980 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NPRL3Q12980 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NPRL3Q12980 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NPRL3Q12980 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
NPRL3Q12980 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NPRL3Q12980 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NPRL3Q12980 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NPRL3Q12980 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NPRL3Q12980 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NPRL3Q12980 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NPRL3Q12980 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NPRL3Q12980 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
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