Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
BPTFQ12830 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
BPTFQ12830 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
BPTFQ12830 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
BPTFQ12830 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
BPTFQ12830 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
BPTFQ12830 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
BPTFQ12830 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
BPTFQ12830 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
BPTFQ12830 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
BPTFQ12830 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
BPTFQ12830 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
BPTFQ12830 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
BPTFQ12830 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
BPTFQ12830 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
BPTFQ12830 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
BPTFQ12830 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
BPTFQ12830 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
BPTFQ12830 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
BPTFQ12830 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
BPTFQ12830 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
BPTFQ12830 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
BPTFQ12830 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
BPTFQ12830 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
BPTFQ12830 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
BPTFQ12830 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
BPTFQ12830 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
BPTFQ12830 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
BPTFQ12830 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
BPTFQ12830 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
BPTFQ12830 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
BPTFQ12830 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
BPTFQ12830 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
BPTFQ12830 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
BPTFQ12830 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
BPTFQ12830 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
BPTFQ12830 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
BPTFQ12830 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
BPTFQ12830 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
BPTFQ12830 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
BPTFQ12830 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
BPTFQ12830 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
BPTFQ12830 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
BPTFQ12830 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
BPTFQ12830 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
BPTFQ12830 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
BPTFQ12830 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
BPTFQ12830 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
BPTFQ12830 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
BPTFQ12830 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
BPTFQ12830 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
BPTFQ12830 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
BPTFQ12830 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
BPTFQ12830 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
BPTFQ12830 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
BPTFQ12830 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
BPTFQ12830 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
BPTFQ12830 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
BPTFQ12830 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
BPTFQ12830 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
BPTFQ12830 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
BPTFQ12830 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
BPTFQ12830 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
BPTFQ12830 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
BPTFQ12830 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
BPTFQ12830 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
BPTFQ12830 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
BPTFQ12830 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
BPTFQ12830 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
BPTFQ12830 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
BPTFQ12830 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
BPTFQ12830 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
BPTFQ12830 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
BPTFQ12830 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
BPTFQ12830 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
BPTFQ12830 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
BPTFQ12830 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
BPTFQ12830 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
BPTFQ12830 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
BPTFQ12830 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
BPTFQ12830 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
BPTFQ12830 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
BPTFQ12830 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
BPTFQ12830 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
BPTFQ12830 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
BPTFQ12830 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
BPTFQ12830 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
BPTFQ12830 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
BPTFQ12830 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
BPTFQ12830 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
BPTFQ12830 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
BPTFQ12830 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
BPTFQ12830 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
BPTFQ12830 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
BPTFQ12830 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
BPTFQ12830 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
BPTFQ12830 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
BPTFQ12830 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
BPTFQ12830 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
BPTFQ12830 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
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