Protein–RNA interactions for Protein: Q12365

BBP1, Spindle pole component BBP1, yeastyeast

Predictions only

Length 385 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
BBP1Q12365 YJL225CYJL225C 5277 nt11.01□□□□□ -0.65
BBP1Q12365 YBL100CYBL100C 315 nt10.91□□□□□ -0.66
BBP1Q12365 RRT12YCR045C 1476 nt10.87□□□□□ -0.67
BBP1Q12365 SRB2YHR041C 633 nt10.87□□□□□ -0.67
BBP1Q12365 BDH2YAL061W 1254 nt10.87□□□□□ -0.67
BBP1Q12365 YKL097CYKL097C 411 nt10.85□□□□□ -0.67
BBP1Q12365 SHU1YHL006C 453 nt10.84□□□□□ -0.67
BBP1Q12365 ALG12YNR030W 1656 nt10.82□□□□□ -0.68
BBP1Q12365 ALF1YNL148C 765 nt10.78□□□□□ -0.68
BBP1Q12365 SPT8YLR055C 1809 nt10.77□□□□□ -0.68
BBP1Q12365 YFL054CYFL054C 1941 nt10.77□□□□□ -0.69
BBP1Q12365 FUN26YAL022C 1554 nt10.76□□□□□ -0.69
BBP1Q12365 TRM9YML014W 840 nt10.74□□□□□ -0.69
BBP1Q12365 HSP60YLR259C 1719 nt10.74□□□□□ -0.69
BBP1Q12365 LSM3YLR438C-A 270 nt10.73□□□□□ -0.69
BBP1Q12365 NCP1YHR042W 2076 nt10.73□□□□□ -0.69
BBP1Q12365 RDN37-1RDN37-1 5354 nt10.72□□□□□ -0.69
BBP1Q12365 RDN37-2RDN37-2 5354 nt10.72□□□□□ -0.69
BBP1Q12365 WWM1YFL010C 636 nt10.71□□□□□ -0.69
BBP1Q12365 YGR021WYGR021W 873 nt10.71□□□□□ -0.69
BBP1Q12365 SIS1YNL007C 1059 nt10.7□□□□□ -0.7
BBP1Q12365 RTS2YOR077W 699 nt10.7□□□□□ -0.7
BBP1Q12365 GFD2YCL036W 1701 nt10.7□□□□□ -0.7
BBP1Q12365 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt10.68□□□□□ -0.7
BBP1Q12365 YNL195CYNL195C 786 nt10.65□□□□□ -0.7
BBP1Q12365 ART5YGR068C 1761 nt10.62□□□□□ -0.71
BBP1Q12365 CCT6YDR188W 1641 nt10.62□□□□□ -0.71
BBP1Q12365 SUF2tP(AGG)C 72 nt10.61□□□□□ -0.71
BBP1Q12365 SUF10tP(AGG)N 72 nt10.61□□□□□ -0.71
BBP1Q12365 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt10.6□□□□□ -0.71
BBP1Q12365 HOM6YJR139C 1080 nt10.6□□□□□ -0.71
BBP1Q12365 CUE1YMR264W 612 nt10.6□□□□□ -0.71
BBP1Q12365 MNP1YGL068W 585 nt10.52□□□□□ -0.73
BBP1Q12365 SWE1YJL187C 2460 nt10.5□□□□□ -0.73
BBP1Q12365 GLK1YCL040W 1503 nt10.5□□□□□ -0.73
BBP1Q12365 NAR1YNL240C 1476 nt10.49□□□□□ -0.73
BBP1Q12365 PET9YBL030C 957 nt10.48□□□□□ -0.73
BBP1Q12365 RKM5YLR137W 1104 nt10.46□□□□□ -0.73
BBP1Q12365 YIL100WYIL100W 354 nt10.44□□□□□ -0.74
BBP1Q12365 YOL037CYOL037C 354 nt10.39□□□□□ -0.75
BBP1Q12365 NPL3YDR432W 1245 nt10.38□□□□□ -0.75
BBP1Q12365 YOR139CYOR139C 393 nt10.36□□□□□ -0.75
BBP1Q12365 YCH1YGR203W 447 nt10.35□□□□□ -0.75
BBP1Q12365 DSK2YMR276W 1122 nt10.35□□□□□ -0.75
BBP1Q12365 LCB1YMR296C 1677 nt10.31□□□□□ -0.76
BBP1Q12365 HSL7YBR133C 2484 nt10.3□□□□□ -0.76
BBP1Q12365 AAC1YMR056C 930 nt10.27□□□□□ -0.77
BBP1Q12365 FUR4YBR021W 1902 nt10.27□□□□□ -0.77
BBP1Q12365 CMP2YML057W 1815 nt10.23□□□□□ -0.77
BBP1Q12365 PBP1YGR178C 2169 nt10.23□□□□□ -0.77
BBP1Q12365 TIR4YOR009W 1464 nt10.23□□□□□ -0.77
BBP1Q12365 PRP4YPR178W 1398 nt10.22□□□□□ -0.77
BBP1Q12365 YLR236CYLR236C 324 nt10.21□□□□□ -0.77
BBP1Q12365 BIO5YNR056C 1686 nt10.2□□□□□ -0.78
BBP1Q12365 CYT2YKL087C 675 nt10.19□□□□□ -0.78
BBP1Q12365 YMR057CYMR057C 372 nt10.19□□□□□ -0.78
BBP1Q12365 DPS1YLL018C 1674 nt10.17□□□□□ -0.78
BBP1Q12365 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt10.16□□□□□ -0.78
BBP1Q12365 YEL076CYEL076C 651 nt10.16□□□□□ -0.78
BBP1Q12365 YLR464WYLR464W 651 nt10.16□□□□□ -0.78
BBP1Q12365 BIO4YNR057C 714 nt10.15□□□□□ -0.78
BBP1Q12365 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt10.13□□□□□ -0.79
BBP1Q12365 RDN25-1RDN25-1 3396 nt10.13□□□□□ -0.79
BBP1Q12365 RDN25-2RDN25-2 3396 nt10.13□□□□□ -0.79
BBP1Q12365 LYS4YDR234W 2082 nt10.13□□□□□ -0.79
BBP1Q12365 DED1YOR204W 1815 nt10.12□□□□□ -0.79
BBP1Q12365 YLR281CYLR281C 468 nt10.1□□□□□ -0.79
BBP1Q12365 WHI5YOR083W 888 nt10.09□□□□□ -0.79
BBP1Q12365 SNF1YDR477W 1902 nt10.08□□□□□ -0.8
BBP1Q12365 YJL152WYJL152W 360 nt10.07□□□□□ -0.8
BBP1Q12365 HEL2YDR266C 1920 nt10.03□□□□□ -0.8
BBP1Q12365 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt10.01□□□□□ -0.81
BBP1Q12365 PUS2YGL063W 1113 nt9.99□□□□□ -0.81
BBP1Q12365 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt9.98□□□□□ -0.81
BBP1Q12365 IMT4tM(CAU)E 72 nt9.98□□□□□ -0.81
BBP1Q12365 IMT3tM(CAU)J3 72 nt9.98□□□□□ -0.81
BBP1Q12365 IMT1tM(CAU)O1 72 nt9.98□□□□□ -0.81
BBP1Q12365 IMT2tM(CAU)P 72 nt9.98□□□□□ -0.81
BBP1Q12365 BMT6YLR063W 1098 nt9.98□□□□□ -0.81
BBP1Q12365 IMP2'YIL154C 1041 nt9.94□□□□□ -0.82
BBP1Q12365 YAT1YAR035W 2064 nt9.93□□□□□ -0.82
BBP1Q12365 YKR005CYKR005C 1578 nt9.92□□□□□ -0.82
BBP1Q12365 IDH1YNL037C 1083 nt9.9□□□□□ -0.82
BBP1Q12365 SIM1YIL123W 1431 nt9.89□□□□□ -0.83
BBP1Q12365 NDI1YML120C 1542 nt9.88□□□□□ -0.83
BBP1Q12365 CCA1YER168C 1641 nt9.88□□□□□ -0.83
BBP1Q12365 IRC24YIR036C 792 nt9.81□□□□□ -0.84
BBP1Q12365 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt9.8□□□□□ -0.84
BBP1Q12365 GBP2YCL011C 1284 nt9.79□□□□□ -0.84
BBP1Q12365 FMP52YER004W 696 nt9.78□□□□□ -0.84
BBP1Q12365 SNG1YGR197C 1644 nt9.78□□□□□ -0.84
BBP1Q12365 FMP45YDL222C 930 nt9.74□□□□□ -0.85
BBP1Q12365 YGR259CYGR259C 441 nt9.74□□□□□ -0.85
BBP1Q12365 RRD1YIL153W 1182 nt9.74□□□□□ -0.85
BBP1Q12365 SPT20YOL148C 1815 nt9.74□□□□□ -0.85
BBP1Q12365 TCD2YKL027W 1344 nt9.73□□□□□ -0.85
BBP1Q12365 WSC2YNL283C 1512 nt9.72□□□□□ -0.85
BBP1Q12365 RIM8YGL045W 1629 nt9.72□□□□□ -0.85
BBP1Q12365 YDR433WYDR433W 441 nt9.72□□□□□ -0.85
BBP1Q12365 YPR011CYPR011C 981 nt9.72□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 959.6 ms