Protein–RNA interactions for Protein: Q12308

TFC8, Transcription factor tau 60 kDa subunit, yeastyeast

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TFC8Q12308 TIR1YER011W 765 nt14.89□□□□□ -0.03
TFC8Q12308 TOM20YGR082W 552 nt14.83□□□□□ -0.04
TFC8Q12308 SRB2YHR041C 633 nt14.83□□□□□ -0.04
TFC8Q12308 NAB2YGL122C 1578 nt14.8□□□□□ -0.04
TFC8Q12308 NEM1YHR004C 1341 nt14.78□□□□□ -0.04
TFC8Q12308 FIS1YIL065C 468 nt14.75□□□□□ -0.05
TFC8Q12308 PHO92YDR374C 921 nt14.7□□□□□ -0.06
TFC8Q12308 HMT1YBR034C 1047 nt14.67□□□□□ -0.06
TFC8Q12308 YHL044WYHL044W 708 nt14.64□□□□□ -0.07
TFC8Q12308 YPL071CYPL071C 471 nt14.63□□□□□ -0.07
TFC8Q12308 URE2YNL229C 1065 nt14.62□□□□□ -0.07
TFC8Q12308 AST1YBL069W 1290 nt14.6□□□□□ -0.07
TFC8Q12308 MET8YBR213W 825 nt14.59□□□□□ -0.07
TFC8Q12308 DAL1YIR027C 1383 nt14.58□□□□□ -0.08
TFC8Q12308 SHU1YHL006C 453 nt14.56□□□□□ -0.08
TFC8Q12308 LCP5YER127W 1074 nt14.55□□□□□ -0.08
TFC8Q12308 YAL016C-BYAL016C-B 186 nt14.55□□□□□ -0.08
TFC8Q12308 STD1YOR047C 1335 nt14.54□□□□□ -0.08
TFC8Q12308 SSA4YER103W 1929 nt14.51□□□□□ -0.09
TFC8Q12308 PHO4YFR034C 939 nt14.49□□□□□ -0.09
TFC8Q12308 CLB6YGR109C 1143 nt14.49□□□□□ -0.09
TFC8Q12308 FPR4YLR449W 1179 nt14.48□□□□□ -0.09
TFC8Q12308 URH1YDR400W 1023 nt14.47□□□□□ -0.09
TFC8Q12308 YOR139CYOR139C 393 nt14.47□□□□□ -0.09
TFC8Q12308 PEX27YOR193W 1131 nt14.47□□□□□ -0.09
TFC8Q12308 RPP2BYDR382W 333 nt14.42□□□□□ -0.1
TFC8Q12308 INM2YDR287W 879 nt14.39□□□□□ -0.11
TFC8Q12308 MEP2YNL142W 1500 nt14.38□□□□□ -0.11
TFC8Q12308 FTR1YER145C 1215 nt14.36□□□□□ -0.11
TFC8Q12308 YPS1YLR120C 1710 nt14.35□□□□□ -0.11
TFC8Q12308 FAR3YMR052W 615 nt14.34□□□□□ -0.11
TFC8Q12308 YMR119W-AYMR119W-A 375 nt14.34□□□□□ -0.11
TFC8Q12308 YBL100CYBL100C 315 nt14.29□□□□□ -0.12
TFC8Q12308 GTT3YEL017W 1014 nt14.28□□□□□ -0.12
TFC8Q12308 DCW1YKL046C 1350 nt14.27□□□□□ -0.12
TFC8Q12308 WWM1YFL010C 636 nt14.26□□□□□ -0.13
TFC8Q12308 RPM1RPM1 483 nt14.26□□□□□ -0.13
TFC8Q12308 NPL3YDR432W 1245 nt14.25□□□□□ -0.13
TFC8Q12308 LSM12YHR121W 564 nt14.24□□□□□ -0.13
TFC8Q12308 BDH2YAL061W 1254 nt14.24□□□□□ -0.13
TFC8Q12308 YDR095CYDR095C 411 nt14.21□□□□□ -0.13
TFC8Q12308 YJL107CYJL107C 1164 nt14.21□□□□□ -0.13
TFC8Q12308 YHM2YMR241W 945 nt14.2□□□□□ -0.14
TFC8Q12308 YLR036CYLR036C 612 nt14.17□□□□□ -0.14
TFC8Q12308 YEL074WYEL074W 339 nt14.16□□□□□ -0.14
TFC8Q12308 MPS2YGL075C 1164 nt14.16□□□□□ -0.14
TFC8Q12308 YNL067W-AYNL067W-A 147 nt14.16□□□□□ -0.14
TFC8Q12308 FUN26YAL022C 1554 nt14.15□□□□□ -0.14
TFC8Q12308 THP3YPR045C 1413 nt14.14□□□□□ -0.15
TFC8Q12308 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt14.12□□□□□ -0.15
TFC8Q12308 YDR008CYDR008C 351 nt14.11□□□□□ -0.15
TFC8Q12308 RSM23YGL129C 1353 nt14.09□□□□□ -0.15
TFC8Q12308 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt14.09□□□□□ -0.15
TFC8Q12308 YMR057CYMR057C 372 nt14.09□□□□□ -0.15
TFC8Q12308 BDF1YLR399C 2061 nt14.09□□□□□ -0.15
TFC8Q12308 PTP1YDL230W 1008 nt14.07□□□□□ -0.16
TFC8Q12308 YJL118WYJL118W 660 nt14.06□□□□□ -0.16
TFC8Q12308 UBC12YLR306W 567 nt14.05□□□□□ -0.16
TFC8Q12308 ARC19YKL013C 516 nt14.04□□□□□ -0.16
TFC8Q12308 PUS9YDL036C 1389 nt14.02□□□□□ -0.17
TFC8Q12308 CAC2YML102W 1407 nt14.01□□□□□ -0.17
TFC8Q12308 HOM6YJR139C 1080 nt14□□□□□ -0.17
TFC8Q12308 YML079WYML079W 606 nt14□□□□□ -0.17
TFC8Q12308 HAS1YMR290C 1518 nt14□□□□□ -0.17
TFC8Q12308 COX3Q0275 810 nt13.99□□□□□ -0.17
TFC8Q12308 IRC14YOR135C 342 nt13.96□□□□□ -0.17
TFC8Q12308 EMI2YDR516C 1503 nt13.95□□□□□ -0.18
TFC8Q12308 MNP1YGL068W 585 nt13.95□□□□□ -0.18
TFC8Q12308 tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 73 nt13.95□□□□□ -0.18
TFC8Q12308 LSM3YLR438C-A 270 nt13.94□□□□□ -0.18
TFC8Q12308 TRM9YML014W 840 nt13.94□□□□□ -0.18
TFC8Q12308 CCT6YDR188W 1641 nt13.93□□□□□ -0.18
TFC8Q12308 MOD5YOR274W 1287 nt13.93□□□□□ -0.18
TFC8Q12308 YNL040WYNL040W 1371 nt13.93□□□□□ -0.18
TFC8Q12308 MPC1YGL080W 393 nt13.91□□□□□ -0.18
TFC8Q12308 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt13.9□□□□□ -0.18
TFC8Q12308 RUF21RUF21 707 nt13.9□□□□□ -0.18
TFC8Q12308 YPR1YDR368W 939 nt13.89□□□□□ -0.19
TFC8Q12308 YMR306C-AYMR306C-A 390 nt13.89□□□□□ -0.19
TFC8Q12308 YBR220CYBR220C 1683 nt13.88□□□□□ -0.19
TFC8Q12308 ARP6YLR085C 1317 nt13.88□□□□□ -0.19
TFC8Q12308 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt13.87□□□□□ -0.19
TFC8Q12308 IMT4tM(CAU)E 72 nt13.87□□□□□ -0.19
TFC8Q12308 IMT3tM(CAU)J3 72 nt13.87□□□□□ -0.19
TFC8Q12308 IMT1tM(CAU)O1 72 nt13.87□□□□□ -0.19
TFC8Q12308 IMT2tM(CAU)P 72 nt13.87□□□□□ -0.19
TFC8Q12308 YGR021WYGR021W 873 nt13.87□□□□□ -0.19
TFC8Q12308 RPP2AYOL039W 321 nt13.87□□□□□ -0.19
TFC8Q12308 VPS28YPL065W 729 nt13.86□□□□□ -0.19
TFC8Q12308 TAT1YBR069C 1860 nt13.85□□□□□ -0.19
TFC8Q12308 ALF1YNL148C 765 nt13.85□□□□□ -0.19
TFC8Q12308 YHP1YDR451C 1062 nt13.84□□□□□ -0.19
TFC8Q12308 SIS1YNL007C 1059 nt13.84□□□□□ -0.19
TFC8Q12308 YDL221WYDL221W 552 nt13.83□□□□□ -0.2
TFC8Q12308 YGL118CYGL118C 438 nt13.83□□□□□ -0.2
TFC8Q12308 YHR054CYHR054C 1065 nt13.83□□□□□ -0.2
TFC8Q12308 CUS2YNL286W 858 nt13.83□□□□□ -0.2
TFC8Q12308 TSR2YLR435W 618 nt13.82□□□□□ -0.2
TFC8Q12308 IDI1YPL117C 867 nt13.82□□□□□ -0.2
TFC8Q12308 YGR011WYGR011W 327 nt13.8□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 46.7 ms