Protein–RNA interactions for Protein: Q06136

KDSR, 3-ketodihydrosphingosine reductase, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDSRQ06136 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
KDSRQ06136 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
KDSRQ06136 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
KDSRQ06136 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
KDSRQ06136 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
KDSRQ06136 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
KDSRQ06136 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
KDSRQ06136 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
KDSRQ06136 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
KDSRQ06136 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
KDSRQ06136 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
KDSRQ06136 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
KDSRQ06136 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
KDSRQ06136 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
KDSRQ06136 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
KDSRQ06136 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
KDSRQ06136 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
KDSRQ06136 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
KDSRQ06136 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
KDSRQ06136 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
KDSRQ06136 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
KDSRQ06136 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
KDSRQ06136 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
KDSRQ06136 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
KDSRQ06136 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
KDSRQ06136 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
KDSRQ06136 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
KDSRQ06136 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
KDSRQ06136 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
KDSRQ06136 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
KDSRQ06136 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
KDSRQ06136 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
KDSRQ06136 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
KDSRQ06136 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
KDSRQ06136 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
KDSRQ06136 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
KDSRQ06136 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
KDSRQ06136 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
KDSRQ06136 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
KDSRQ06136 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
KDSRQ06136 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
KDSRQ06136 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
KDSRQ06136 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
KDSRQ06136 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
KDSRQ06136 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
KDSRQ06136 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
KDSRQ06136 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
KDSRQ06136 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
KDSRQ06136 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
KDSRQ06136 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
KDSRQ06136 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
KDSRQ06136 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
KDSRQ06136 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
KDSRQ06136 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
KDSRQ06136 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
KDSRQ06136 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
KDSRQ06136 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
KDSRQ06136 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
KDSRQ06136 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
KDSRQ06136 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
KDSRQ06136 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
KDSRQ06136 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
KDSRQ06136 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
KDSRQ06136 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
KDSRQ06136 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
KDSRQ06136 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
KDSRQ06136 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC29.2■■■□□ 2.26
KDSRQ06136 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
KDSRQ06136 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
KDSRQ06136 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
KDSRQ06136 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
KDSRQ06136 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
KDSRQ06136 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
KDSRQ06136 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
KDSRQ06136 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
KDSRQ06136 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
KDSRQ06136 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
KDSRQ06136 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
KDSRQ06136 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
KDSRQ06136 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
KDSRQ06136 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
KDSRQ06136 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
KDSRQ06136 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
KDSRQ06136 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
KDSRQ06136 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
KDSRQ06136 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
KDSRQ06136 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
KDSRQ06136 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
KDSRQ06136 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
KDSRQ06136 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
KDSRQ06136 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
KDSRQ06136 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
KDSRQ06136 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
KDSRQ06136 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
KDSRQ06136 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
KDSRQ06136 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
KDSRQ06136 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
KDSRQ06136 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
KDSRQ06136 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
KDSRQ06136 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms