Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
GRIN1Q05586 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
GRIN1Q05586 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
GRIN1Q05586 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
GRIN1Q05586 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
GRIN1Q05586 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
GRIN1Q05586 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
GRIN1Q05586 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
GRIN1Q05586 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
GRIN1Q05586 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
GRIN1Q05586 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
GRIN1Q05586 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
GRIN1Q05586 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
GRIN1Q05586 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
GRIN1Q05586 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
GRIN1Q05586 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
GRIN1Q05586 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
GRIN1Q05586 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
GRIN1Q05586 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
GRIN1Q05586 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
GRIN1Q05586 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
GRIN1Q05586 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
GRIN1Q05586 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
GRIN1Q05586 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
GRIN1Q05586 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
GRIN1Q05586 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
GRIN1Q05586 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
GRIN1Q05586 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
GRIN1Q05586 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
GRIN1Q05586 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
GRIN1Q05586 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
GRIN1Q05586 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
GRIN1Q05586 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
GRIN1Q05586 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
GRIN1Q05586 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
GRIN1Q05586 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
GRIN1Q05586 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
GRIN1Q05586 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
GRIN1Q05586 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
GRIN1Q05586 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
GRIN1Q05586 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
GRIN1Q05586 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
GRIN1Q05586 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
GRIN1Q05586 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
GRIN1Q05586 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
GRIN1Q05586 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
GRIN1Q05586 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
GRIN1Q05586 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
GRIN1Q05586 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
GRIN1Q05586 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
GRIN1Q05586 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
GRIN1Q05586 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
GRIN1Q05586 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
GRIN1Q05586 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
GRIN1Q05586 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
GRIN1Q05586 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
GRIN1Q05586 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
GRIN1Q05586 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC31.98■■■□□ 2.71
GRIN1Q05586 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
GRIN1Q05586 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
GRIN1Q05586 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
GRIN1Q05586 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
GRIN1Q05586 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
GRIN1Q05586 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
GRIN1Q05586 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
GRIN1Q05586 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
GRIN1Q05586 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
GRIN1Q05586 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC31.87■■■□□ 2.69
GRIN1Q05586 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
GRIN1Q05586 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
GRIN1Q05586 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
GRIN1Q05586 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
GRIN1Q05586 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
GRIN1Q05586 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
GRIN1Q05586 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.69
GRIN1Q05586 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
GRIN1Q05586 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
GRIN1Q05586 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
GRIN1Q05586 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
GRIN1Q05586 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
GRIN1Q05586 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
GRIN1Q05586 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
GRIN1Q05586 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
GRIN1Q05586 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
GRIN1Q05586 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
GRIN1Q05586 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
GRIN1Q05586 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
GRIN1Q05586 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
GRIN1Q05586 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
GRIN1Q05586 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
GRIN1Q05586 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
GRIN1Q05586 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
GRIN1Q05586 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
GRIN1Q05586 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
GRIN1Q05586 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
GRIN1Q05586 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
GRIN1Q05586 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
GRIN1Q05586 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
GRIN1Q05586 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC31.63■■■□□ 2.65
GRIN1Q05586 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.4 ms