Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
PTPN12Q05209 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
PTPN12Q05209 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC35.99■■■■□ 3.35
PTPN12Q05209 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
PTPN12Q05209 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
PTPN12Q05209 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC35.95■■■■□ 3.35
PTPN12Q05209 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
PTPN12Q05209 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
PTPN12Q05209 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC35.87■■■■□ 3.33
PTPN12Q05209 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
PTPN12Q05209 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
PTPN12Q05209 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC35.85■■■■□ 3.33
PTPN12Q05209 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
PTPN12Q05209 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
PTPN12Q05209 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
PTPN12Q05209 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.33
PTPN12Q05209 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
PTPN12Q05209 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC35.81■■■■□ 3.32
PTPN12Q05209 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC35.77■■■■□ 3.32
PTPN12Q05209 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC35.77■■■■□ 3.32
PTPN12Q05209 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
PTPN12Q05209 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.31
PTPN12Q05209 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
PTPN12Q05209 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
PTPN12Q05209 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
PTPN12Q05209 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
PTPN12Q05209 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.7■■■■□ 3.31
PTPN12Q05209 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
PTPN12Q05209 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
PTPN12Q05209 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
PTPN12Q05209 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
PTPN12Q05209 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
PTPN12Q05209 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
PTPN12Q05209 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
PTPN12Q05209 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
PTPN12Q05209 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
PTPN12Q05209 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.28
PTPN12Q05209 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
PTPN12Q05209 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
PTPN12Q05209 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
PTPN12Q05209 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
PTPN12Q05209 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC35.43■■■■□ 3.26
PTPN12Q05209 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
PTPN12Q05209 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC35.41■■■■□ 3.26
PTPN12Q05209 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
PTPN12Q05209 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC35.37■■■■□ 3.25
PTPN12Q05209 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
PTPN12Q05209 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC35.36■■■■□ 3.25
PTPN12Q05209 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
PTPN12Q05209 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
PTPN12Q05209 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
PTPN12Q05209 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
PTPN12Q05209 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
PTPN12Q05209 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
PTPN12Q05209 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC35.24■■■■□ 3.23
PTPN12Q05209 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
PTPN12Q05209 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
PTPN12Q05209 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
PTPN12Q05209 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
PTPN12Q05209 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
PTPN12Q05209 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
PTPN12Q05209 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
PTPN12Q05209 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
PTPN12Q05209 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
PTPN12Q05209 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC35.1■■■■□ 3.21
PTPN12Q05209 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
PTPN12Q05209 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
PTPN12Q05209 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC35.09■■■■□ 3.21
PTPN12Q05209 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
PTPN12Q05209 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
PTPN12Q05209 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
PTPN12Q05209 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC35.04■■■■□ 3.2
PTPN12Q05209 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
PTPN12Q05209 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
PTPN12Q05209 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
PTPN12Q05209 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
PTPN12Q05209 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.19
PTPN12Q05209 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
PTPN12Q05209 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
PTPN12Q05209 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
PTPN12Q05209 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
PTPN12Q05209 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
PTPN12Q05209 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
PTPN12Q05209 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
PTPN12Q05209 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
PTPN12Q05209 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC34.84■■■■□ 3.17
PTPN12Q05209 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
PTPN12Q05209 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
PTPN12Q05209 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
PTPN12Q05209 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
PTPN12Q05209 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
PTPN12Q05209 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC34.82■■■■□ 3.16
PTPN12Q05209 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.81■■■■□ 3.16
PTPN12Q05209 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
PTPN12Q05209 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
PTPN12Q05209 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
PTPN12Q05209 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
PTPN12Q05209 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC34.74■■■■□ 3.15
PTPN12Q05209 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
PTPN12Q05209 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC34.73■■■■□ 3.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms