Protein–RNA interactions for Protein: Q03938

ZNF90, Zinc finger protein 90, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF90Q03938 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF90Q03938 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF90Q03938 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF90Q03938 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF90Q03938 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF90Q03938 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF90Q03938 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF90Q03938 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF90Q03938 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF90Q03938 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZNF90Q03938 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF90Q03938 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF90Q03938 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF90Q03938 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF90Q03938 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF90Q03938 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ZNF90Q03938 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF90Q03938 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF90Q03938 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF90Q03938 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF90Q03938 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF90Q03938 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF90Q03938 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF90Q03938 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF90Q03938 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF90Q03938 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF90Q03938 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF90Q03938 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF90Q03938 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF90Q03938 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF90Q03938 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF90Q03938 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF90Q03938 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ZNF90Q03938 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF90Q03938 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF90Q03938 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF90Q03938 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF90Q03938 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF90Q03938 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF90Q03938 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF90Q03938 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF90Q03938 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF90Q03938 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF90Q03938 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF90Q03938 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF90Q03938 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF90Q03938 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF90Q03938 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF90Q03938 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF90Q03938 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF90Q03938 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF90Q03938 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF90Q03938 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF90Q03938 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF90Q03938 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF90Q03938 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF90Q03938 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF90Q03938 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF90Q03938 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF90Q03938 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF90Q03938 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF90Q03938 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF90Q03938 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF90Q03938 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF90Q03938 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF90Q03938 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF90Q03938 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF90Q03938 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF90Q03938 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF90Q03938 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF90Q03938 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF90Q03938 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF90Q03938 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF90Q03938 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF90Q03938 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF90Q03938 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF90Q03938 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF90Q03938 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF90Q03938 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF90Q03938 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF90Q03938 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF90Q03938 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF90Q03938 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF90Q03938 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF90Q03938 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF90Q03938 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF90Q03938 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF90Q03938 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF90Q03938 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF90Q03938 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF90Q03938 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ZNF90Q03938 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF90Q03938 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF90Q03938 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF90Q03938 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF90Q03938 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF90Q03938 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF90Q03938 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF90Q03938 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF90Q03938 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms