Protein–RNA interactions for Protein: Q00532

CDKL1, Cyclin-dependent kinase-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL1Q00532 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CDKL1Q00532 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CDKL1Q00532 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CDKL1Q00532 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CDKL1Q00532 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CDKL1Q00532 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CDKL1Q00532 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CDKL1Q00532 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CDKL1Q00532 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CDKL1Q00532 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CDKL1Q00532 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDKL1Q00532 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CDKL1Q00532 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CDKL1Q00532 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDKL1Q00532 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CDKL1Q00532 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CDKL1Q00532 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDKL1Q00532 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CDKL1Q00532 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CDKL1Q00532 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CDKL1Q00532 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CDKL1Q00532 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CDKL1Q00532 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CDKL1Q00532 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CDKL1Q00532 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CDKL1Q00532 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CDKL1Q00532 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CDKL1Q00532 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CDKL1Q00532 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CDKL1Q00532 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDKL1Q00532 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CDKL1Q00532 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CDKL1Q00532 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CDKL1Q00532 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CDKL1Q00532 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CDKL1Q00532 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CDKL1Q00532 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CDKL1Q00532 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CDKL1Q00532 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CDKL1Q00532 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CDKL1Q00532 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CDKL1Q00532 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CDKL1Q00532 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CDKL1Q00532 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CDKL1Q00532 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CDKL1Q00532 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CDKL1Q00532 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDKL1Q00532 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CDKL1Q00532 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CDKL1Q00532 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CDKL1Q00532 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CDKL1Q00532 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CDKL1Q00532 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CDKL1Q00532 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDKL1Q00532 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CDKL1Q00532 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CDKL1Q00532 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CDKL1Q00532 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CDKL1Q00532 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CDKL1Q00532 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDKL1Q00532 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CDKL1Q00532 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CDKL1Q00532 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CDKL1Q00532 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CDKL1Q00532 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
CDKL1Q00532 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CDKL1Q00532 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CDKL1Q00532 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CDKL1Q00532 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CDKL1Q00532 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CDKL1Q00532 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CDKL1Q00532 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CDKL1Q00532 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDKL1Q00532 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDKL1Q00532 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CDKL1Q00532 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CDKL1Q00532 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CDKL1Q00532 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CDKL1Q00532 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CDKL1Q00532 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CDKL1Q00532 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CDKL1Q00532 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CDKL1Q00532 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CDKL1Q00532 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CDKL1Q00532 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CDKL1Q00532 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CDKL1Q00532 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CDKL1Q00532 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CDKL1Q00532 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CDKL1Q00532 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CDKL1Q00532 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CDKL1Q00532 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CDKL1Q00532 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
CDKL1Q00532 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CDKL1Q00532 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CDKL1Q00532 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CDKL1Q00532 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CDKL1Q00532 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CDKL1Q00532 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CDKL1Q00532 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms