Protein–RNA interactions for Protein: P78426

NKX6-1, Homeobox protein Nkx-6.1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX6-1P78426 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NKX6-1P78426 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NKX6-1P78426 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NKX6-1P78426 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NKX6-1P78426 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
NKX6-1P78426 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NKX6-1P78426 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NKX6-1P78426 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NKX6-1P78426 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NKX6-1P78426 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NKX6-1P78426 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NKX6-1P78426 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NKX6-1P78426 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NKX6-1P78426 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NKX6-1P78426 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NKX6-1P78426 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NKX6-1P78426 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NKX6-1P78426 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NKX6-1P78426 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NKX6-1P78426 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NKX6-1P78426 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NKX6-1P78426 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
NKX6-1P78426 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NKX6-1P78426 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NKX6-1P78426 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NKX6-1P78426 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NKX6-1P78426 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NKX6-1P78426 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NKX6-1P78426 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NKX6-1P78426 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NKX6-1P78426 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NKX6-1P78426 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NKX6-1P78426 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NKX6-1P78426 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NKX6-1P78426 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NKX6-1P78426 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NKX6-1P78426 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NKX6-1P78426 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NKX6-1P78426 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NKX6-1P78426 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NKX6-1P78426 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NKX6-1P78426 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NKX6-1P78426 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
NKX6-1P78426 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
NKX6-1P78426 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NKX6-1P78426 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NKX6-1P78426 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NKX6-1P78426 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NKX6-1P78426 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NKX6-1P78426 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NKX6-1P78426 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NKX6-1P78426 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NKX6-1P78426 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NKX6-1P78426 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NKX6-1P78426 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NKX6-1P78426 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NKX6-1P78426 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NKX6-1P78426 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NKX6-1P78426 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NKX6-1P78426 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NKX6-1P78426 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NKX6-1P78426 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NKX6-1P78426 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NKX6-1P78426 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NKX6-1P78426 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
NKX6-1P78426 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NKX6-1P78426 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NKX6-1P78426 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NKX6-1P78426 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NKX6-1P78426 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NKX6-1P78426 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NKX6-1P78426 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NKX6-1P78426 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NKX6-1P78426 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
NKX6-1P78426 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NKX6-1P78426 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NKX6-1P78426 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NKX6-1P78426 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NKX6-1P78426 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
NKX6-1P78426 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NKX6-1P78426 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NKX6-1P78426 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NKX6-1P78426 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NKX6-1P78426 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NKX6-1P78426 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NKX6-1P78426 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NKX6-1P78426 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NKX6-1P78426 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NKX6-1P78426 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NKX6-1P78426 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NKX6-1P78426 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NKX6-1P78426 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NKX6-1P78426 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NKX6-1P78426 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NKX6-1P78426 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NKX6-1P78426 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NKX6-1P78426 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NKX6-1P78426 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NKX6-1P78426 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NKX6-1P78426 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.5 ms