Protein–RNA interactions for Protein: P62491

RAB11A, Ras-related protein Rab-11A, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11AP62491 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB11AP62491 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB11AP62491 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB11AP62491 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB11AP62491 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RAB11AP62491 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RAB11AP62491 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAB11AP62491 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAB11AP62491 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB11AP62491 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB11AP62491 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB11AP62491 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB11AP62491 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB11AP62491 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB11AP62491 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB11AP62491 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB11AP62491 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB11AP62491 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB11AP62491 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB11AP62491 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB11AP62491 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB11AP62491 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB11AP62491 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RAB11AP62491 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB11AP62491 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB11AP62491 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB11AP62491 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB11AP62491 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB11AP62491 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB11AP62491 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB11AP62491 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB11AP62491 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB11AP62491 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB11AP62491 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB11AP62491 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RAB11AP62491 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB11AP62491 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB11AP62491 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB11AP62491 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB11AP62491 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB11AP62491 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB11AP62491 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RAB11AP62491 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB11AP62491 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB11AP62491 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB11AP62491 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB11AP62491 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB11AP62491 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB11AP62491 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB11AP62491 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB11AP62491 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB11AP62491 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB11AP62491 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB11AP62491 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB11AP62491 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB11AP62491 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB11AP62491 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB11AP62491 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
RAB11AP62491 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB11AP62491 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB11AP62491 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB11AP62491 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB11AP62491 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB11AP62491 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB11AP62491 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB11AP62491 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB11AP62491 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RAB11AP62491 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RAB11AP62491 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB11AP62491 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB11AP62491 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB11AP62491 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB11AP62491 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB11AP62491 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB11AP62491 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB11AP62491 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB11AP62491 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB11AP62491 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB11AP62491 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB11AP62491 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB11AP62491 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB11AP62491 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB11AP62491 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB11AP62491 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB11AP62491 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB11AP62491 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB11AP62491 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB11AP62491 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB11AP62491 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB11AP62491 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB11AP62491 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB11AP62491 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB11AP62491 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB11AP62491 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB11AP62491 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB11AP62491 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB11AP62491 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB11AP62491 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB11AP62491 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB11AP62491 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.3 ms