Protein–RNA interactions for Protein: P61923

COPZ1, Coatomer subunit zeta-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPZ1P61923 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
COPZ1P61923 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
COPZ1P61923 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
COPZ1P61923 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
COPZ1P61923 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
COPZ1P61923 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
COPZ1P61923 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
COPZ1P61923 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
COPZ1P61923 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
COPZ1P61923 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
COPZ1P61923 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
COPZ1P61923 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
COPZ1P61923 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
COPZ1P61923 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
COPZ1P61923 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
COPZ1P61923 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
COPZ1P61923 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
COPZ1P61923 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
COPZ1P61923 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
COPZ1P61923 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
COPZ1P61923 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
COPZ1P61923 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
COPZ1P61923 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
COPZ1P61923 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
COPZ1P61923 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
COPZ1P61923 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
COPZ1P61923 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
COPZ1P61923 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
COPZ1P61923 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
COPZ1P61923 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
COPZ1P61923 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
COPZ1P61923 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
COPZ1P61923 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
COPZ1P61923 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
COPZ1P61923 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
COPZ1P61923 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
COPZ1P61923 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
COPZ1P61923 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
COPZ1P61923 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
COPZ1P61923 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
COPZ1P61923 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
COPZ1P61923 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
COPZ1P61923 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
COPZ1P61923 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
COPZ1P61923 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
COPZ1P61923 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
COPZ1P61923 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
COPZ1P61923 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
COPZ1P61923 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
COPZ1P61923 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
COPZ1P61923 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
COPZ1P61923 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
COPZ1P61923 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
COPZ1P61923 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
COPZ1P61923 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
COPZ1P61923 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
COPZ1P61923 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
COPZ1P61923 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
COPZ1P61923 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
COPZ1P61923 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
COPZ1P61923 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
COPZ1P61923 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
COPZ1P61923 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
COPZ1P61923 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
COPZ1P61923 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
COPZ1P61923 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
COPZ1P61923 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
COPZ1P61923 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
COPZ1P61923 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
COPZ1P61923 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
COPZ1P61923 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
COPZ1P61923 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
COPZ1P61923 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
COPZ1P61923 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
COPZ1P61923 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
COPZ1P61923 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
COPZ1P61923 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
COPZ1P61923 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
COPZ1P61923 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
COPZ1P61923 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
COPZ1P61923 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
COPZ1P61923 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
COPZ1P61923 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
COPZ1P61923 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
COPZ1P61923 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
COPZ1P61923 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
COPZ1P61923 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
COPZ1P61923 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
COPZ1P61923 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
COPZ1P61923 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
COPZ1P61923 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
COPZ1P61923 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
COPZ1P61923 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
COPZ1P61923 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
COPZ1P61923 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
COPZ1P61923 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
COPZ1P61923 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
COPZ1P61923 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
COPZ1P61923 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
COPZ1P61923 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms