Protein–RNA interactions for Protein: P61916

NPC2, Epididymal secretory protein E1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC2P61916 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NPC2P61916 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NPC2P61916 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NPC2P61916 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NPC2P61916 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NPC2P61916 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NPC2P61916 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NPC2P61916 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NPC2P61916 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
NPC2P61916 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NPC2P61916 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NPC2P61916 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NPC2P61916 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NPC2P61916 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NPC2P61916 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NPC2P61916 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NPC2P61916 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NPC2P61916 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NPC2P61916 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NPC2P61916 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NPC2P61916 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NPC2P61916 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NPC2P61916 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NPC2P61916 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
NPC2P61916 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
NPC2P61916 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
NPC2P61916 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NPC2P61916 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NPC2P61916 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NPC2P61916 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NPC2P61916 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NPC2P61916 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NPC2P61916 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NPC2P61916 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NPC2P61916 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NPC2P61916 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NPC2P61916 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NPC2P61916 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NPC2P61916 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NPC2P61916 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NPC2P61916 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NPC2P61916 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NPC2P61916 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NPC2P61916 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NPC2P61916 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NPC2P61916 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
NPC2P61916 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NPC2P61916 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NPC2P61916 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NPC2P61916 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NPC2P61916 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NPC2P61916 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NPC2P61916 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NPC2P61916 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NPC2P61916 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NPC2P61916 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NPC2P61916 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NPC2P61916 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NPC2P61916 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NPC2P61916 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NPC2P61916 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NPC2P61916 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NPC2P61916 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NPC2P61916 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NPC2P61916 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NPC2P61916 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NPC2P61916 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NPC2P61916 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NPC2P61916 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NPC2P61916 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NPC2P61916 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NPC2P61916 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
NPC2P61916 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NPC2P61916 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NPC2P61916 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NPC2P61916 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NPC2P61916 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NPC2P61916 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NPC2P61916 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NPC2P61916 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NPC2P61916 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NPC2P61916 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NPC2P61916 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NPC2P61916 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NPC2P61916 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NPC2P61916 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NPC2P61916 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NPC2P61916 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NPC2P61916 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NPC2P61916 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NPC2P61916 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NPC2P61916 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NPC2P61916 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NPC2P61916 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NPC2P61916 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NPC2P61916 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NPC2P61916 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NPC2P61916 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NPC2P61916 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NPC2P61916 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms