Protein–RNA interactions for Protein: P61266

STX1B, Syntaxin-1B, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX1BP61266 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
STX1BP61266 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
STX1BP61266 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
STX1BP61266 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
STX1BP61266 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
STX1BP61266 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
STX1BP61266 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
STX1BP61266 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
STX1BP61266 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
STX1BP61266 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
STX1BP61266 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
STX1BP61266 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
STX1BP61266 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
STX1BP61266 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
STX1BP61266 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
STX1BP61266 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
STX1BP61266 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
STX1BP61266 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
STX1BP61266 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
STX1BP61266 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
STX1BP61266 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
STX1BP61266 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
STX1BP61266 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
STX1BP61266 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
STX1BP61266 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
STX1BP61266 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
STX1BP61266 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
STX1BP61266 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
STX1BP61266 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
STX1BP61266 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
STX1BP61266 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
STX1BP61266 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
STX1BP61266 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
STX1BP61266 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
STX1BP61266 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
STX1BP61266 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
STX1BP61266 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
STX1BP61266 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
STX1BP61266 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
STX1BP61266 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
STX1BP61266 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
STX1BP61266 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
STX1BP61266 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
STX1BP61266 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
STX1BP61266 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
STX1BP61266 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
STX1BP61266 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
STX1BP61266 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
STX1BP61266 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
STX1BP61266 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
STX1BP61266 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
STX1BP61266 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
STX1BP61266 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
STX1BP61266 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
STX1BP61266 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
STX1BP61266 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
STX1BP61266 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
STX1BP61266 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
STX1BP61266 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
STX1BP61266 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
STX1BP61266 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
STX1BP61266 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
STX1BP61266 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
STX1BP61266 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
STX1BP61266 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
STX1BP61266 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
STX1BP61266 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
STX1BP61266 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
STX1BP61266 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
STX1BP61266 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
STX1BP61266 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
STX1BP61266 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
STX1BP61266 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
STX1BP61266 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
STX1BP61266 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
STX1BP61266 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
STX1BP61266 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
STX1BP61266 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
STX1BP61266 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
STX1BP61266 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
STX1BP61266 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
STX1BP61266 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
STX1BP61266 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
STX1BP61266 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
STX1BP61266 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
STX1BP61266 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
STX1BP61266 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
STX1BP61266 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
STX1BP61266 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
STX1BP61266 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
STX1BP61266 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
STX1BP61266 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
STX1BP61266 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
STX1BP61266 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
STX1BP61266 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
STX1BP61266 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
STX1BP61266 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
STX1BP61266 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
STX1BP61266 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
STX1BP61266 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.8 ms