Protein–RNA interactions for Protein: P59990

KRTAP12-1, Keratin-associated protein 12-1, humanhuman

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP12-1P59990 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KRTAP12-1P59990 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
KRTAP12-1P59990 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
KRTAP12-1P59990 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
KRTAP12-1P59990 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
KRTAP12-1P59990 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
KRTAP12-1P59990 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
KRTAP12-1P59990 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
KRTAP12-1P59990 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
KRTAP12-1P59990 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
KRTAP12-1P59990 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
KRTAP12-1P59990 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
KRTAP12-1P59990 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
KRTAP12-1P59990 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
KRTAP12-1P59990 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
KRTAP12-1P59990 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
KRTAP12-1P59990 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
KRTAP12-1P59990 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
KRTAP12-1P59990 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
KRTAP12-1P59990 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
KRTAP12-1P59990 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
KRTAP12-1P59990 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
KRTAP12-1P59990 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
KRTAP12-1P59990 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
KRTAP12-1P59990 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
KRTAP12-1P59990 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
KRTAP12-1P59990 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
KRTAP12-1P59990 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
KRTAP12-1P59990 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
KRTAP12-1P59990 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
KRTAP12-1P59990 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
KRTAP12-1P59990 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
KRTAP12-1P59990 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
KRTAP12-1P59990 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
KRTAP12-1P59990 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
KRTAP12-1P59990 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
KRTAP12-1P59990 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
KRTAP12-1P59990 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
KRTAP12-1P59990 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
KRTAP12-1P59990 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
KRTAP12-1P59990 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
KRTAP12-1P59990 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
KRTAP12-1P59990 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
KRTAP12-1P59990 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
KRTAP12-1P59990 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
KRTAP12-1P59990 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
KRTAP12-1P59990 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
KRTAP12-1P59990 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
KRTAP12-1P59990 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
KRTAP12-1P59990 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
KRTAP12-1P59990 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
KRTAP12-1P59990 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
KRTAP12-1P59990 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
KRTAP12-1P59990 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
KRTAP12-1P59990 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
KRTAP12-1P59990 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
KRTAP12-1P59990 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
KRTAP12-1P59990 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
KRTAP12-1P59990 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
KRTAP12-1P59990 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
KRTAP12-1P59990 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
KRTAP12-1P59990 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
KRTAP12-1P59990 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
KRTAP12-1P59990 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
KRTAP12-1P59990 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
KRTAP12-1P59990 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
KRTAP12-1P59990 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
KRTAP12-1P59990 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
KRTAP12-1P59990 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
KRTAP12-1P59990 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
KRTAP12-1P59990 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
KRTAP12-1P59990 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
KRTAP12-1P59990 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
KRTAP12-1P59990 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
KRTAP12-1P59990 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
KRTAP12-1P59990 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
KRTAP12-1P59990 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
KRTAP12-1P59990 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
KRTAP12-1P59990 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
KRTAP12-1P59990 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
KRTAP12-1P59990 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
KRTAP12-1P59990 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
KRTAP12-1P59990 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
KRTAP12-1P59990 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
KRTAP12-1P59990 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
KRTAP12-1P59990 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
KRTAP12-1P59990 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
KRTAP12-1P59990 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
KRTAP12-1P59990 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
KRTAP12-1P59990 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
KRTAP12-1P59990 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
KRTAP12-1P59990 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
KRTAP12-1P59990 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
KRTAP12-1P59990 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
KRTAP12-1P59990 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
KRTAP12-1P59990 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
KRTAP12-1P59990 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
KRTAP12-1P59990 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
KRTAP12-1P59990 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
KRTAP12-1P59990 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.4 ms