Protein–RNA interactions for Protein: P55000

SLURP1, Secreted Ly-6/uPAR-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLURP1P55000 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLURP1P55000 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLURP1P55000 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SLURP1P55000 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLURP1P55000 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLURP1P55000 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLURP1P55000 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLURP1P55000 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLURP1P55000 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLURP1P55000 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLURP1P55000 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLURP1P55000 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLURP1P55000 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SLURP1P55000 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLURP1P55000 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLURP1P55000 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLURP1P55000 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLURP1P55000 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLURP1P55000 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLURP1P55000 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLURP1P55000 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLURP1P55000 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLURP1P55000 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLURP1P55000 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLURP1P55000 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLURP1P55000 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLURP1P55000 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SLURP1P55000 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLURP1P55000 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLURP1P55000 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLURP1P55000 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLURP1P55000 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLURP1P55000 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLURP1P55000 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLURP1P55000 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLURP1P55000 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLURP1P55000 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLURP1P55000 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLURP1P55000 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLURP1P55000 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLURP1P55000 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLURP1P55000 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLURP1P55000 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLURP1P55000 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLURP1P55000 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLURP1P55000 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLURP1P55000 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLURP1P55000 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLURP1P55000 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLURP1P55000 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLURP1P55000 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLURP1P55000 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLURP1P55000 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLURP1P55000 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLURP1P55000 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLURP1P55000 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLURP1P55000 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLURP1P55000 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLURP1P55000 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
SLURP1P55000 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLURP1P55000 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLURP1P55000 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLURP1P55000 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLURP1P55000 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLURP1P55000 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLURP1P55000 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLURP1P55000 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLURP1P55000 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLURP1P55000 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLURP1P55000 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLURP1P55000 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLURP1P55000 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SLURP1P55000 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLURP1P55000 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLURP1P55000 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLURP1P55000 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLURP1P55000 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLURP1P55000 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLURP1P55000 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLURP1P55000 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLURP1P55000 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLURP1P55000 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLURP1P55000 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLURP1P55000 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLURP1P55000 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLURP1P55000 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLURP1P55000 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLURP1P55000 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLURP1P55000 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLURP1P55000 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLURP1P55000 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SLURP1P55000 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLURP1P55000 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLURP1P55000 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLURP1P55000 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLURP1P55000 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLURP1P55000 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLURP1P55000 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLURP1P55000 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLURP1P55000 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms