Protein–RNA interactions for Protein: P54619

PRKAG1, 5'-AMP-activated protein kinase subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAG1P54619 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRKAG1P54619 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PRKAG1P54619 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRKAG1P54619 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRKAG1P54619 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRKAG1P54619 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PRKAG1P54619 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
PRKAG1P54619 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PRKAG1P54619 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRKAG1P54619 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRKAG1P54619 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRKAG1P54619 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRKAG1P54619 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRKAG1P54619 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRKAG1P54619 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRKAG1P54619 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRKAG1P54619 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRKAG1P54619 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRKAG1P54619 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
PRKAG1P54619 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRKAG1P54619 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRKAG1P54619 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRKAG1P54619 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRKAG1P54619 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRKAG1P54619 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRKAG1P54619 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRKAG1P54619 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRKAG1P54619 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRKAG1P54619 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PRKAG1P54619 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRKAG1P54619 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRKAG1P54619 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRKAG1P54619 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PRKAG1P54619 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRKAG1P54619 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRKAG1P54619 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRKAG1P54619 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRKAG1P54619 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRKAG1P54619 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRKAG1P54619 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRKAG1P54619 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRKAG1P54619 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRKAG1P54619 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRKAG1P54619 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRKAG1P54619 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PRKAG1P54619 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRKAG1P54619 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRKAG1P54619 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRKAG1P54619 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRKAG1P54619 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRKAG1P54619 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRKAG1P54619 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRKAG1P54619 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRKAG1P54619 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRKAG1P54619 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRKAG1P54619 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRKAG1P54619 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PRKAG1P54619 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PRKAG1P54619 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRKAG1P54619 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRKAG1P54619 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRKAG1P54619 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRKAG1P54619 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PRKAG1P54619 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRKAG1P54619 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRKAG1P54619 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRKAG1P54619 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRKAG1P54619 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRKAG1P54619 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRKAG1P54619 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRKAG1P54619 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRKAG1P54619 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRKAG1P54619 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRKAG1P54619 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRKAG1P54619 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRKAG1P54619 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRKAG1P54619 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRKAG1P54619 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRKAG1P54619 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
PRKAG1P54619 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRKAG1P54619 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRKAG1P54619 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRKAG1P54619 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRKAG1P54619 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRKAG1P54619 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRKAG1P54619 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRKAG1P54619 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRKAG1P54619 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRKAG1P54619 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRKAG1P54619 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRKAG1P54619 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRKAG1P54619 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRKAG1P54619 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRKAG1P54619 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRKAG1P54619 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRKAG1P54619 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PRKAG1P54619 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRKAG1P54619 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRKAG1P54619 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRKAG1P54619 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms