Protein–RNA interactions for Protein: P53708

ITGA8, Integrin alpha-8, humanhuman

Predictions only

Length 1,063 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA8P53708 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ITGA8P53708 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ITGA8P53708 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ITGA8P53708 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ITGA8P53708 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ITGA8P53708 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ITGA8P53708 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ITGA8P53708 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ITGA8P53708 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ITGA8P53708 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ITGA8P53708 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ITGA8P53708 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.3
ITGA8P53708 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ITGA8P53708 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ITGA8P53708 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ITGA8P53708 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ITGA8P53708 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ITGA8P53708 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ITGA8P53708 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ITGA8P53708 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ITGA8P53708 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ITGA8P53708 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ITGA8P53708 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ITGA8P53708 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ITGA8P53708 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ITGA8P53708 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ITGA8P53708 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ITGA8P53708 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ITGA8P53708 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ITGA8P53708 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ITGA8P53708 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ITGA8P53708 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ITGA8P53708 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ITGA8P53708 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ITGA8P53708 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
ITGA8P53708 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ITGA8P53708 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ITGA8P53708 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ITGA8P53708 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ITGA8P53708 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ITGA8P53708 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
ITGA8P53708 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
ITGA8P53708 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ITGA8P53708 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ITGA8P53708 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ITGA8P53708 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ITGA8P53708 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ITGA8P53708 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ITGA8P53708 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ITGA8P53708 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ITGA8P53708 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ITGA8P53708 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ITGA8P53708 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ITGA8P53708 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ITGA8P53708 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ITGA8P53708 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ITGA8P53708 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ITGA8P53708 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ITGA8P53708 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ITGA8P53708 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ITGA8P53708 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ITGA8P53708 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ITGA8P53708 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ITGA8P53708 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ITGA8P53708 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ITGA8P53708 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ITGA8P53708 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
ITGA8P53708 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ITGA8P53708 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ITGA8P53708 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ITGA8P53708 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ITGA8P53708 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ITGA8P53708 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ITGA8P53708 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ITGA8P53708 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ITGA8P53708 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ITGA8P53708 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ITGA8P53708 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ITGA8P53708 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ITGA8P53708 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ITGA8P53708 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ITGA8P53708 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ITGA8P53708 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ITGA8P53708 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ITGA8P53708 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ITGA8P53708 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ITGA8P53708 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ITGA8P53708 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ITGA8P53708 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ITGA8P53708 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ITGA8P53708 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ITGA8P53708 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ITGA8P53708 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ITGA8P53708 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ITGA8P53708 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ITGA8P53708 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ITGA8P53708 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ITGA8P53708 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ITGA8P53708 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ITGA8P53708 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms