Protein–RNA interactions for Protein: P53370

NUDT6, Nucleoside diphosphate-linked moiety X motif 6, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDT6P53370 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NUDT6P53370 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NUDT6P53370 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NUDT6P53370 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NUDT6P53370 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NUDT6P53370 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NUDT6P53370 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NUDT6P53370 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NUDT6P53370 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NUDT6P53370 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NUDT6P53370 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NUDT6P53370 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NUDT6P53370 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NUDT6P53370 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NUDT6P53370 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NUDT6P53370 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NUDT6P53370 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NUDT6P53370 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NUDT6P53370 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NUDT6P53370 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NUDT6P53370 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NUDT6P53370 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NUDT6P53370 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NUDT6P53370 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
NUDT6P53370 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NUDT6P53370 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NUDT6P53370 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NUDT6P53370 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NUDT6P53370 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NUDT6P53370 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NUDT6P53370 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NUDT6P53370 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NUDT6P53370 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NUDT6P53370 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NUDT6P53370 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NUDT6P53370 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NUDT6P53370 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
NUDT6P53370 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NUDT6P53370 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NUDT6P53370 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NUDT6P53370 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26■■□□□ 1.75
NUDT6P53370 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NUDT6P53370 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NUDT6P53370 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
NUDT6P53370 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NUDT6P53370 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
NUDT6P53370 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NUDT6P53370 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NUDT6P53370 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NUDT6P53370 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NUDT6P53370 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NUDT6P53370 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NUDT6P53370 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NUDT6P53370 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NUDT6P53370 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NUDT6P53370 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NUDT6P53370 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NUDT6P53370 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NUDT6P53370 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NUDT6P53370 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NUDT6P53370 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NUDT6P53370 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NUDT6P53370 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NUDT6P53370 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NUDT6P53370 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NUDT6P53370 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NUDT6P53370 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
NUDT6P53370 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NUDT6P53370 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NUDT6P53370 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NUDT6P53370 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NUDT6P53370 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NUDT6P53370 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NUDT6P53370 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NUDT6P53370 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NUDT6P53370 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NUDT6P53370 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NUDT6P53370 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NUDT6P53370 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NUDT6P53370 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NUDT6P53370 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NUDT6P53370 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NUDT6P53370 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NUDT6P53370 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NUDT6P53370 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NUDT6P53370 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NUDT6P53370 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NUDT6P53370 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NUDT6P53370 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NUDT6P53370 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NUDT6P53370 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NUDT6P53370 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NUDT6P53370 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NUDT6P53370 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NUDT6P53370 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NUDT6P53370 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NUDT6P53370 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NUDT6P53370 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NUDT6P53370 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NUDT6P53370 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms