Protein–RNA interactions for Protein: P53370

NUDT6, Nucleoside diphosphate-linked moiety X motif 6, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDT6P53370 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NUDT6P53370 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NUDT6P53370 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NUDT6P53370 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NUDT6P53370 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NUDT6P53370 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NUDT6P53370 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NUDT6P53370 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NUDT6P53370 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NUDT6P53370 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NUDT6P53370 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NUDT6P53370 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NUDT6P53370 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NUDT6P53370 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NUDT6P53370 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NUDT6P53370 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NUDT6P53370 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NUDT6P53370 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NUDT6P53370 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NUDT6P53370 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NUDT6P53370 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NUDT6P53370 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NUDT6P53370 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NUDT6P53370 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
NUDT6P53370 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NUDT6P53370 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NUDT6P53370 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NUDT6P53370 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NUDT6P53370 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NUDT6P53370 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NUDT6P53370 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NUDT6P53370 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NUDT6P53370 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NUDT6P53370 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NUDT6P53370 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NUDT6P53370 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NUDT6P53370 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
NUDT6P53370 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NUDT6P53370 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NUDT6P53370 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NUDT6P53370 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26■■□□□ 1.75
NUDT6P53370 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NUDT6P53370 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NUDT6P53370 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
NUDT6P53370 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NUDT6P53370 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
NUDT6P53370 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NUDT6P53370 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NUDT6P53370 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NUDT6P53370 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NUDT6P53370 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NUDT6P53370 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NUDT6P53370 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NUDT6P53370 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NUDT6P53370 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NUDT6P53370 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NUDT6P53370 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NUDT6P53370 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NUDT6P53370 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NUDT6P53370 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NUDT6P53370 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NUDT6P53370 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NUDT6P53370 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NUDT6P53370 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NUDT6P53370 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NUDT6P53370 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NUDT6P53370 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
NUDT6P53370 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NUDT6P53370 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NUDT6P53370 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NUDT6P53370 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NUDT6P53370 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NUDT6P53370 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NUDT6P53370 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NUDT6P53370 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NUDT6P53370 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NUDT6P53370 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NUDT6P53370 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NUDT6P53370 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NUDT6P53370 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NUDT6P53370 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NUDT6P53370 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NUDT6P53370 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NUDT6P53370 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NUDT6P53370 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NUDT6P53370 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NUDT6P53370 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NUDT6P53370 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NUDT6P53370 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NUDT6P53370 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NUDT6P53370 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NUDT6P53370 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NUDT6P53370 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NUDT6P53370 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NUDT6P53370 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NUDT6P53370 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NUDT6P53370 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NUDT6P53370 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NUDT6P53370 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NUDT6P53370 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms