Protein–RNA interactions for Protein: P53063

RAI1, Decapping nuclease RAI1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RAI1P53063 TRM9YML014W 840 nt11.29□□□□□ -0.6
RAI1P53063 YHL050CYHL050C 2094 nt11.29□□□□□ -0.6
RAI1P53063 CCT6YDR188W 1641 nt11.24□□□□□ -0.61
RAI1P53063 RTF1YGL244W 1677 nt11.24□□□□□ -0.61
RAI1P53063 GFD2YCL036W 1701 nt11.23□□□□□ -0.61
RAI1P53063 ART5YGR068C 1761 nt11.21□□□□□ -0.62
RAI1P53063 RTS2YOR077W 699 nt11.18□□□□□ -0.62
RAI1P53063 RRT12YCR045C 1476 nt11.17□□□□□ -0.62
RAI1P53063 SUF2tP(AGG)C 72 nt11.14□□□□□ -0.63
RAI1P53063 SUF10tP(AGG)N 72 nt11.14□□□□□ -0.63
RAI1P53063 PTK1YKL198C 1989 nt11.14□□□□□ -0.63
RAI1P53063 LSM3YLR438C-A 270 nt11.12□□□□□ -0.63
RAI1P53063 BOP3YNL042W 1191 nt11.11□□□□□ -0.63
RAI1P53063 WWM1YFL010C 636 nt11.08□□□□□ -0.64
RAI1P53063 PET9YBL030C 957 nt11.07□□□□□ -0.64
RAI1P53063 CUE1YMR264W 612 nt11.07□□□□□ -0.64
RAI1P53063 YNL195CYNL195C 786 nt10.97□□□□□ -0.65
RAI1P53063 NCP1YHR042W 2076 nt10.96□□□□□ -0.66
RAI1P53063 YCH1YGR203W 447 nt10.92□□□□□ -0.66
RAI1P53063 TIR4YOR009W 1464 nt10.92□□□□□ -0.66
RAI1P53063 YIL100WYIL100W 354 nt10.89□□□□□ -0.67
RAI1P53063 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt10.88□□□□□ -0.67
RAI1P53063 YMR057CYMR057C 372 nt10.87□□□□□ -0.67
RAI1P53063 BOR1YNL275W 1731 nt10.85□□□□□ -0.67
RAI1P53063 UME6YDR207C 2511 nt10.84□□□□□ -0.67
RAI1P53063 YFL054CYFL054C 1941 nt10.84□□□□□ -0.67
RAI1P53063 SPT8YLR055C 1809 nt10.81□□□□□ -0.68
RAI1P53063 PST2YDR032C 597 nt10.8□□□□□ -0.68
RAI1P53063 YLR236CYLR236C 324 nt10.77□□□□□ -0.69
RAI1P53063 YGR021WYGR021W 873 nt10.76□□□□□ -0.69
RAI1P53063 HOM6YJR139C 1080 nt10.73□□□□□ -0.69
RAI1P53063 LCB1YMR296C 1677 nt10.68□□□□□ -0.7
RAI1P53063 NME1NME1 340 nt10.65□□□□□ -0.7
RAI1P53063 NPL3YDR432W 1245 nt10.59□□□□□ -0.71
RAI1P53063 SWE1YJL187C 2460 nt10.58□□□□□ -0.72
RAI1P53063 MNP1YGL068W 585 nt10.58□□□□□ -0.72
RAI1P53063 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt10.58□□□□□ -0.72
RAI1P53063 HSP60YLR259C 1719 nt10.58□□□□□ -0.72
RAI1P53063 RKM5YLR137W 1104 nt10.56□□□□□ -0.72
RAI1P53063 YJL225CYJL225C 5277 nt10.55□□□□□ -0.72
RAI1P53063 SHU1YHL006C 453 nt10.52□□□□□ -0.73
RAI1P53063 MCH5YOR306C 1566 nt10.52□□□□□ -0.73
RAI1P53063 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt10.51□□□□□ -0.73
RAI1P53063 ALG12YNR030W 1656 nt10.5□□□□□ -0.73
RAI1P53063 LYS4YDR234W 2082 nt10.49□□□□□ -0.73
RAI1P53063 YJL152WYJL152W 360 nt10.48□□□□□ -0.73
RAI1P53063 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt10.43□□□□□ -0.74
RAI1P53063 GLK1YCL040W 1503 nt10.42□□□□□ -0.74
RAI1P53063 SIM1YIL123W 1431 nt10.39□□□□□ -0.75
RAI1P53063 RRD1YIL153W 1182 nt10.35□□□□□ -0.75
RAI1P53063 PCM1YEL058W 1674 nt10.32□□□□□ -0.76
RAI1P53063 FUR4YBR021W 1902 nt10.31□□□□□ -0.76
RAI1P53063 BIO4YNR057C 714 nt10.28□□□□□ -0.76
RAI1P53063 FMP52YER004W 696 nt10.27□□□□□ -0.77
RAI1P53063 YGR139WYGR139W 339 nt10.23□□□□□ -0.77
RAI1P53063 DED1YOR204W 1815 nt10.23□□□□□ -0.77
RAI1P53063 FMT1YBL013W 1206 nt10.2□□□□□ -0.78
RAI1P53063 PRP4YPR178W 1398 nt10.19□□□□□ -0.78
RAI1P53063 NAR1YNL240C 1476 nt10.18□□□□□ -0.78
RAI1P53063 DSK2YMR276W 1122 nt10.18□□□□□ -0.78
RAI1P53063 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt10.17□□□□□ -0.78
RAI1P53063 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt10.16□□□□□ -0.78
RAI1P53063 YEL076CYEL076C 651 nt10.16□□□□□ -0.78
RAI1P53063 YLR464WYLR464W 651 nt10.16□□□□□ -0.78
RAI1P53063 AAC1YMR056C 930 nt10.16□□□□□ -0.78
RAI1P53063 ADH2YMR303C 1047 nt10.16□□□□□ -0.78
RAI1P53063 CCA1YER168C 1641 nt10.15□□□□□ -0.78
RAI1P53063 DPS1YLL018C 1674 nt10.15□□□□□ -0.79
RAI1P53063 CRR1YLR213C 1269 nt10.14□□□□□ -0.79
RAI1P53063 SNF6YHL025W 999 nt10.13□□□□□ -0.79
RAI1P53063 CWP1YKL096W 720 nt10.12□□□□□ -0.79
RAI1P53063 ERF2YLR246W 1080 nt10.12□□□□□ -0.79
RAI1P53063 GBP2YCL011C 1284 nt10.12□□□□□ -0.79
RAI1P53063 BIO5YNR056C 1686 nt10.09□□□□□ -0.79
RAI1P53063 TCD2YKL027W 1344 nt10.08□□□□□ -0.8
RAI1P53063 YOL037CYOL037C 354 nt10.08□□□□□ -0.8
RAI1P53063 MIC10YCL057C-A 294 nt10.08□□□□□ -0.8
RAI1P53063 IDH1YNL037C 1083 nt10.07□□□□□ -0.8
RAI1P53063 RAX1YOR301W 1308 nt10.06□□□□□ -0.8
RAI1P53063 SNF1YDR477W 1902 nt10.05□□□□□ -0.8
RAI1P53063 PBP1YGR178C 2169 nt10.04□□□□□ -0.8
RAI1P53063 RPM1RPM1 483 nt10.04□□□□□ -0.8
RAI1P53063 HEM12YDR047W 1089 nt10.03□□□□□ -0.8
RAI1P53063 WHI5YOR083W 888 nt10.02□□□□□ -0.81
RAI1P53063 YKR005CYKR005C 1578 nt10.01□□□□□ -0.81
RAI1P53063 ATF2YGR177C 1608 nt10□□□□□ -0.81
RAI1P53063 YIH1YCR059C 777 nt10□□□□□ -0.81
RAI1P53063 YLL053CYLL053C 459 nt9.99□□□□□ -0.81
RAI1P53063 SNG1YGR197C 1644 nt9.99□□□□□ -0.81
RAI1P53063 BMT6YLR063W 1098 nt9.98□□□□□ -0.81
RAI1P53063 RDN37-1RDN37-1 5354 nt9.97□□□□□ -0.81
RAI1P53063 RDN37-2RDN37-2 5354 nt9.97□□□□□ -0.81
RAI1P53063 CYT2YKL087C 675 nt9.97□□□□□ -0.81
RAI1P53063 SOR2YDL246C 1074 nt9.95□□□□□ -0.82
RAI1P53063 SOR1YJR159W 1074 nt9.95□□□□□ -0.82
RAI1P53063 YKL097CYKL097C 411 nt9.94□□□□□ -0.82
RAI1P53063 YLR281CYLR281C 468 nt9.94□□□□□ -0.82
RAI1P53063 RNQ1YCL028W 1218 nt9.92□□□□□ -0.82
RAI1P53063 WSC2YNL283C 1512 nt9.92□□□□□ -0.82
RAI1P53063 YFL067WYFL067W 528 nt9.9□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 8.3 ms