Protein–RNA interactions for Protein: P52907

CAPZA1, F-actin-capping protein subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZA1P52907 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CAPZA1P52907 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CAPZA1P52907 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CAPZA1P52907 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CAPZA1P52907 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CAPZA1P52907 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CAPZA1P52907 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CAPZA1P52907 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CAPZA1P52907 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CAPZA1P52907 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CAPZA1P52907 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CAPZA1P52907 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CAPZA1P52907 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CAPZA1P52907 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CAPZA1P52907 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CAPZA1P52907 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CAPZA1P52907 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAPZA1P52907 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAPZA1P52907 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAPZA1P52907 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAPZA1P52907 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CAPZA1P52907 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CAPZA1P52907 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAPZA1P52907 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAPZA1P52907 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAPZA1P52907 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAPZA1P52907 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CAPZA1P52907 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CAPZA1P52907 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAPZA1P52907 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAPZA1P52907 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CAPZA1P52907 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAPZA1P52907 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAPZA1P52907 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAPZA1P52907 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAPZA1P52907 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CAPZA1P52907 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CAPZA1P52907 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CAPZA1P52907 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CAPZA1P52907 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAPZA1P52907 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAPZA1P52907 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAPZA1P52907 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAPZA1P52907 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAPZA1P52907 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAPZA1P52907 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAPZA1P52907 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAPZA1P52907 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CAPZA1P52907 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAPZA1P52907 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAPZA1P52907 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAPZA1P52907 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAPZA1P52907 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAPZA1P52907 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAPZA1P52907 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAPZA1P52907 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAPZA1P52907 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAPZA1P52907 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAPZA1P52907 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAPZA1P52907 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAPZA1P52907 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAPZA1P52907 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAPZA1P52907 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAPZA1P52907 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAPZA1P52907 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAPZA1P52907 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAPZA1P52907 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAPZA1P52907 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAPZA1P52907 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAPZA1P52907 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CAPZA1P52907 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CAPZA1P52907 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CAPZA1P52907 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAPZA1P52907 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAPZA1P52907 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAPZA1P52907 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAPZA1P52907 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAPZA1P52907 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAPZA1P52907 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAPZA1P52907 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAPZA1P52907 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAPZA1P52907 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAPZA1P52907 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAPZA1P52907 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAPZA1P52907 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAPZA1P52907 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAPZA1P52907 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAPZA1P52907 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CAPZA1P52907 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAPZA1P52907 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAPZA1P52907 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CAPZA1P52907 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAPZA1P52907 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAPZA1P52907 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAPZA1P52907 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAPZA1P52907 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAPZA1P52907 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAPZA1P52907 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CAPZA1P52907 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CAPZA1P52907 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms