Protein–RNA interactions for Protein: P51160

PDE6C, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6CP51160 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
PDE6CP51160 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
PDE6CP51160 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
PDE6CP51160 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.54
PDE6CP51160 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PDE6CP51160 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PDE6CP51160 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC30.86■■■□□ 2.53
PDE6CP51160 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC30.84■■■□□ 2.53
PDE6CP51160 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
PDE6CP51160 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
PDE6CP51160 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
PDE6CP51160 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
PDE6CP51160 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
PDE6CP51160 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
PDE6CP51160 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
PDE6CP51160 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
PDE6CP51160 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
PDE6CP51160 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
PDE6CP51160 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
PDE6CP51160 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
PDE6CP51160 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
PDE6CP51160 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
PDE6CP51160 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
PDE6CP51160 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
PDE6CP51160 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
PDE6CP51160 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
PDE6CP51160 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
PDE6CP51160 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
PDE6CP51160 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
PDE6CP51160 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
PDE6CP51160 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
PDE6CP51160 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
PDE6CP51160 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
PDE6CP51160 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
PDE6CP51160 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
PDE6CP51160 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
PDE6CP51160 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
PDE6CP51160 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
PDE6CP51160 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PDE6CP51160 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PDE6CP51160 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
PDE6CP51160 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
PDE6CP51160 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
PDE6CP51160 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
PDE6CP51160 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
PDE6CP51160 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PDE6CP51160 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
PDE6CP51160 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PDE6CP51160 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
PDE6CP51160 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PDE6CP51160 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PDE6CP51160 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
PDE6CP51160 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PDE6CP51160 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
PDE6CP51160 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
PDE6CP51160 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
PDE6CP51160 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
PDE6CP51160 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PDE6CP51160 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
PDE6CP51160 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
PDE6CP51160 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
PDE6CP51160 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
PDE6CP51160 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
PDE6CP51160 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
PDE6CP51160 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
PDE6CP51160 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PDE6CP51160 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PDE6CP51160 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PDE6CP51160 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
PDE6CP51160 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
PDE6CP51160 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PDE6CP51160 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PDE6CP51160 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PDE6CP51160 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PDE6CP51160 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
PDE6CP51160 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
PDE6CP51160 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
PDE6CP51160 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
PDE6CP51160 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PDE6CP51160 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PDE6CP51160 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PDE6CP51160 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PDE6CP51160 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PDE6CP51160 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PDE6CP51160 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PDE6CP51160 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PDE6CP51160 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PDE6CP51160 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
PDE6CP51160 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
PDE6CP51160 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
PDE6CP51160 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
PDE6CP51160 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PDE6CP51160 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PDE6CP51160 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PDE6CP51160 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PDE6CP51160 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PDE6CP51160 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PDE6CP51160 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
PDE6CP51160 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
PDE6CP51160 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms