Protein–RNA interactions for Protein: P49459

UBE2A, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 A, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2AP49459 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBE2AP49459 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBE2AP49459 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBE2AP49459 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBE2AP49459 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBE2AP49459 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBE2AP49459 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBE2AP49459 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE2AP49459 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE2AP49459 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBE2AP49459 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBE2AP49459 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBE2AP49459 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBE2AP49459 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
UBE2AP49459 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBE2AP49459 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBE2AP49459 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBE2AP49459 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBE2AP49459 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
UBE2AP49459 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBE2AP49459 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBE2AP49459 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBE2AP49459 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBE2AP49459 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBE2AP49459 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBE2AP49459 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE2AP49459 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBE2AP49459 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBE2AP49459 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBE2AP49459 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBE2AP49459 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBE2AP49459 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
UBE2AP49459 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBE2AP49459 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBE2AP49459 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBE2AP49459 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBE2AP49459 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBE2AP49459 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBE2AP49459 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBE2AP49459 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBE2AP49459 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBE2AP49459 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
UBE2AP49459 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
UBE2AP49459 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
UBE2AP49459 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
UBE2AP49459 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
UBE2AP49459 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
UBE2AP49459 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
UBE2AP49459 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
UBE2AP49459 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
UBE2AP49459 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBE2AP49459 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
UBE2AP49459 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBE2AP49459 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBE2AP49459 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
UBE2AP49459 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
UBE2AP49459 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UBE2AP49459 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UBE2AP49459 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UBE2AP49459 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UBE2AP49459 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
UBE2AP49459 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
UBE2AP49459 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
UBE2AP49459 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
UBE2AP49459 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
UBE2AP49459 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
UBE2AP49459 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
UBE2AP49459 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBE2AP49459 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBE2AP49459 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBE2AP49459 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBE2AP49459 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBE2AP49459 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBE2AP49459 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBE2AP49459 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBE2AP49459 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
UBE2AP49459 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBE2AP49459 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBE2AP49459 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBE2AP49459 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBE2AP49459 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBE2AP49459 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBE2AP49459 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBE2AP49459 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE2AP49459 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE2AP49459 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE2AP49459 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE2AP49459 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
UBE2AP49459 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
UBE2AP49459 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
UBE2AP49459 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
UBE2AP49459 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
UBE2AP49459 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBE2AP49459 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBE2AP49459 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBE2AP49459 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBE2AP49459 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBE2AP49459 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBE2AP49459 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBE2AP49459 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms