Protein–RNA interactions for Protein: P48444

ARCN1, Coatomer subunit delta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARCN1P48444 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ARCN1P48444 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ARCN1P48444 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ARCN1P48444 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ARCN1P48444 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ARCN1P48444 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
ARCN1P48444 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ARCN1P48444 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ARCN1P48444 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ARCN1P48444 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ARCN1P48444 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ARCN1P48444 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ARCN1P48444 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ARCN1P48444 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ARCN1P48444 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ARCN1P48444 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ARCN1P48444 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ARCN1P48444 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ARCN1P48444 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ARCN1P48444 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ARCN1P48444 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
ARCN1P48444 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ARCN1P48444 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ARCN1P48444 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ARCN1P48444 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ARCN1P48444 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ARCN1P48444 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ARCN1P48444 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ARCN1P48444 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ARCN1P48444 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ARCN1P48444 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ARCN1P48444 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ARCN1P48444 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ARCN1P48444 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ARCN1P48444 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ARCN1P48444 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ARCN1P48444 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ARCN1P48444 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ARCN1P48444 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ARCN1P48444 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ARCN1P48444 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ARCN1P48444 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ARCN1P48444 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ARCN1P48444 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ARCN1P48444 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ARCN1P48444 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ARCN1P48444 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ARCN1P48444 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ARCN1P48444 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ARCN1P48444 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ARCN1P48444 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ARCN1P48444 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ARCN1P48444 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ARCN1P48444 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ARCN1P48444 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ARCN1P48444 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ARCN1P48444 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ARCN1P48444 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ARCN1P48444 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ARCN1P48444 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ARCN1P48444 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
ARCN1P48444 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ARCN1P48444 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ARCN1P48444 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ARCN1P48444 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ARCN1P48444 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ARCN1P48444 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ARCN1P48444 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ARCN1P48444 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ARCN1P48444 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ARCN1P48444 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ARCN1P48444 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ARCN1P48444 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ARCN1P48444 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ARCN1P48444 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ARCN1P48444 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ARCN1P48444 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ARCN1P48444 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ARCN1P48444 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ARCN1P48444 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ARCN1P48444 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ARCN1P48444 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ARCN1P48444 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ARCN1P48444 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ARCN1P48444 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ARCN1P48444 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ARCN1P48444 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
ARCN1P48444 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ARCN1P48444 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ARCN1P48444 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ARCN1P48444 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
ARCN1P48444 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ARCN1P48444 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ARCN1P48444 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
ARCN1P48444 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ARCN1P48444 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
ARCN1P48444 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ARCN1P48444 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ARCN1P48444 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ARCN1P48444 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.6 ms