Protein–RNA interactions for Protein: P48169

GABRA4, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA4P48169 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
GABRA4P48169 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
GABRA4P48169 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GABRA4P48169 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GABRA4P48169 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GABRA4P48169 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GABRA4P48169 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GABRA4P48169 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GABRA4P48169 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GABRA4P48169 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GABRA4P48169 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GABRA4P48169 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
GABRA4P48169 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.57■■■□□ 2
GABRA4P48169 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
GABRA4P48169 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GABRA4P48169 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GABRA4P48169 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.51■■■□□ 2
GABRA4P48169 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GABRA4P48169 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GABRA4P48169 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GABRA4P48169 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GABRA4P48169 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GABRA4P48169 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GABRA4P48169 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GABRA4P48169 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
GABRA4P48169 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GABRA4P48169 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GABRA4P48169 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GABRA4P48169 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GABRA4P48169 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GABRA4P48169 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GABRA4P48169 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GABRA4P48169 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
GABRA4P48169 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GABRA4P48169 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GABRA4P48169 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GABRA4P48169 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GABRA4P48169 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GABRA4P48169 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GABRA4P48169 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GABRA4P48169 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GABRA4P48169 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GABRA4P48169 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GABRA4P48169 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GABRA4P48169 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GABRA4P48169 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
GABRA4P48169 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GABRA4P48169 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GABRA4P48169 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
GABRA4P48169 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GABRA4P48169 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GABRA4P48169 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GABRA4P48169 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GABRA4P48169 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GABRA4P48169 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GABRA4P48169 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GABRA4P48169 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GABRA4P48169 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GABRA4P48169 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GABRA4P48169 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GABRA4P48169 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GABRA4P48169 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GABRA4P48169 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GABRA4P48169 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GABRA4P48169 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GABRA4P48169 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GABRA4P48169 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GABRA4P48169 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
GABRA4P48169 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
GABRA4P48169 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GABRA4P48169 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GABRA4P48169 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GABRA4P48169 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GABRA4P48169 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GABRA4P48169 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GABRA4P48169 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GABRA4P48169 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
GABRA4P48169 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GABRA4P48169 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GABRA4P48169 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GABRA4P48169 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GABRA4P48169 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GABRA4P48169 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GABRA4P48169 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GABRA4P48169 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GABRA4P48169 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GABRA4P48169 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GABRA4P48169 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GABRA4P48169 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GABRA4P48169 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GABRA4P48169 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
GABRA4P48169 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GABRA4P48169 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GABRA4P48169 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GABRA4P48169 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GABRA4P48169 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GABRA4P48169 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GABRA4P48169 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GABRA4P48169 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GABRA4P48169 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms