Protein–RNA interactions for Protein: P45973

CBX5, Chromobox protein homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX5P45973 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CBX5P45973 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CBX5P45973 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CBX5P45973 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CBX5P45973 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CBX5P45973 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CBX5P45973 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CBX5P45973 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CBX5P45973 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CBX5P45973 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CBX5P45973 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CBX5P45973 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CBX5P45973 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CBX5P45973 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CBX5P45973 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CBX5P45973 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CBX5P45973 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CBX5P45973 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CBX5P45973 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CBX5P45973 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CBX5P45973 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CBX5P45973 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CBX5P45973 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CBX5P45973 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CBX5P45973 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CBX5P45973 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CBX5P45973 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CBX5P45973 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CBX5P45973 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CBX5P45973 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CBX5P45973 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CBX5P45973 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CBX5P45973 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CBX5P45973 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CBX5P45973 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CBX5P45973 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CBX5P45973 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CBX5P45973 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CBX5P45973 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CBX5P45973 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CBX5P45973 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CBX5P45973 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CBX5P45973 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CBX5P45973 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CBX5P45973 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CBX5P45973 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CBX5P45973 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CBX5P45973 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CBX5P45973 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CBX5P45973 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CBX5P45973 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CBX5P45973 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CBX5P45973 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CBX5P45973 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CBX5P45973 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CBX5P45973 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CBX5P45973 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CBX5P45973 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CBX5P45973 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CBX5P45973 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CBX5P45973 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CBX5P45973 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CBX5P45973 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CBX5P45973 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CBX5P45973 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CBX5P45973 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CBX5P45973 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CBX5P45973 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CBX5P45973 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CBX5P45973 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CBX5P45973 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CBX5P45973 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CBX5P45973 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CBX5P45973 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CBX5P45973 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CBX5P45973 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CBX5P45973 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CBX5P45973 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CBX5P45973 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CBX5P45973 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CBX5P45973 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CBX5P45973 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CBX5P45973 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CBX5P45973 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CBX5P45973 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CBX5P45973 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CBX5P45973 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CBX5P45973 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CBX5P45973 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CBX5P45973 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CBX5P45973 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CBX5P45973 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CBX5P45973 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CBX5P45973 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CBX5P45973 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CBX5P45973 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CBX5P45973 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CBX5P45973 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CBX5P45973 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CBX5P45973 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms