Protein–RNA interactions for Protein: P42574

CASP3, Caspase-3, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP3P42574 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CASP3P42574 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CASP3P42574 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CASP3P42574 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CASP3P42574 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CASP3P42574 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CASP3P42574 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CASP3P42574 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CASP3P42574 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CASP3P42574 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CASP3P42574 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CASP3P42574 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CASP3P42574 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
CASP3P42574 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CASP3P42574 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CASP3P42574 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CASP3P42574 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CASP3P42574 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CASP3P42574 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CASP3P42574 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CASP3P42574 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CASP3P42574 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CASP3P42574 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CASP3P42574 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CASP3P42574 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CASP3P42574 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CASP3P42574 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CASP3P42574 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CASP3P42574 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CASP3P42574 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CASP3P42574 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CASP3P42574 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CASP3P42574 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CASP3P42574 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CASP3P42574 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CASP3P42574 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CASP3P42574 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CASP3P42574 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
CASP3P42574 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CASP3P42574 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CASP3P42574 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CASP3P42574 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CASP3P42574 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CASP3P42574 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CASP3P42574 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CASP3P42574 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CASP3P42574 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CASP3P42574 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CASP3P42574 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CASP3P42574 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CASP3P42574 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CASP3P42574 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CASP3P42574 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CASP3P42574 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CASP3P42574 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CASP3P42574 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CASP3P42574 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CASP3P42574 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CASP3P42574 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CASP3P42574 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CASP3P42574 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CASP3P42574 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CASP3P42574 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CASP3P42574 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CASP3P42574 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CASP3P42574 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CASP3P42574 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CASP3P42574 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CASP3P42574 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CASP3P42574 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CASP3P42574 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CASP3P42574 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CASP3P42574 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CASP3P42574 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CASP3P42574 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CASP3P42574 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CASP3P42574 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CASP3P42574 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CASP3P42574 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CASP3P42574 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CASP3P42574 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CASP3P42574 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CASP3P42574 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CASP3P42574 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CASP3P42574 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CASP3P42574 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CASP3P42574 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CASP3P42574 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CASP3P42574 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CASP3P42574 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CASP3P42574 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CASP3P42574 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CASP3P42574 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CASP3P42574 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CASP3P42574 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CASP3P42574 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CASP3P42574 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CASP3P42574 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CASP3P42574 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CASP3P42574 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms